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Published on: September 17, 2019
Enfoque de modelado mixto para caracterizar los efectos genéticos en un fenotipo longitudinal
Pei Zhang1, Paul S Albert1, Hyokyoung G Hong1
1Biostatistics Branch, Division of Cancer Epidemiology and Genetics, National Cancer Institute.
Este estudio introduce un nuevo método para estimar los efectos genéticos en los niveles de antígeno prostático específico (PSA) a lo largo del tiempo. Comprender estas influencias genéticas puede mejorar la precisión de la detección del cáncer de próstata para los individuos.
Área de la Ciencia:
- Estadísticas biológicas
- La genética
- Epidemiología del cáncer
Sus antecedentes:
- Los fenotipos longitudinales no se utilizan para estimar los efectos genéticos individuales.
- Los métodos actuales a menudo se centran en puntos de tiempo únicos, descuidando las variaciones de trayectoria.
- Comprender las influencias genéticas en los biomarcadores longitudinales es crucial para la medicina personalizada.
Objetivo del estudio:
- Desarrollar y aplicar un enfoque de modelado mixto para estimar los efectos genéticos tanto en la línea de base como en la pendiente de las trayectorias longitudinales.
- Caracterizar las trayectorias del antígeno prostático específico (PSA) en individuos libres de cáncer de próstata utilizando este nuevo método.
- Evaluar el papel de los factores genéticos en la variabilidad del PSA y sus implicaciones para el cribado del cáncer de próstata.
Principales métodos:
- Un enfoque de modelado mixto que incorpora efectos aleatorios genéticos y específicos del individuo.
- Utilizando un algoritmo de probabilidad máxima restringida de información promedio (AI-ReML) para la estimación del componente de varianza.
- Análisis de los datos longitudinales de PSA de los participantes en el ensayo de detección de cáncer de próstata, pulmón, colorrectal y ovario (PLCO).
Principales resultados:
- Se identificaron contribuciones genéticas significativas tanto para los niveles iniciales de PSA como para su tasa de cambio a lo largo del tiempo.
- El método identificó con éxito a individuos con una alta predisposición genética a niveles elevados de PSA en la línea de base y las trayectorias.
- Los factores genéticos influyen en la variabilidad del PSA en individuos que no tienen cáncer de próstata.
Conclusiones:
- La incorporación de factores genéticos en el monitoreo longitudinal del PSA mejora la precisión de la detección del cáncer de próstata.
- Los conocimientos genéticos pueden ayudar a identificar a las personas en riesgo de ser falsamente positivas debido a la trayectoria del PSA.
- Este enfoque ofrece una comprensión más matizada de las influencias genéticas en los biomarcadores del cáncer.
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