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Updated: Sep 9, 2025

07:41
Performing Data Mining And Integrative Analysis Of Biomarker in Breast Cancer Using Multiple Publicly Accessible Databases
Published on: May 17, 2019
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Exploración de genes pronósticos asociados con la linfangiogénesis en el cáncer de mama basados en transcriptómica y
Chen Liu1, Tuo Zhang2, Fushen Luo2
1Department of Clinical Laboratory, The Third Affiliated Hospital of Qiqihar Medical University, Qiqihar, Heilongjiang, China.
PeerJ
|September 2, 2025
Resumen
Los investigadores identificaron cuatro genes clave (ZIC2, CD24, CEBPD, CCL19) relacionados con la linfangiogénesis del cáncer de mama (BC). Estos genes ofrecen nuevos objetivos potenciales para las estrategias de diagnóstico y tratamiento de la BC.
Área de la Ciencia:
- En el campo de la oncología
- Biología molecular
- La genética
Sus antecedentes:
- El cáncer de mama (BC) es un problema de salud importante, a menudo impulsado por mutaciones BRCA1/2 en casos hereditarios.
- La linfangiogénesis está implicada en la progresión de la BC, destacando la necesidad de comprender sus factores genéticos.
Objetivo del estudio:
- Identificar genes pronósticos asociados con la linfangiogénesis en el cáncer de mama.
- Explorar los mecanismos biológicos y el potencial terapéutico de estos genes.
Principales métodos:
- Utilizó conjuntos de datos públicos para encontrar genes expresados diferencialmente (DEG) y genes relacionados con la linfangiogénesis (LRG).
- Aplicó regresión univariada de Cox y aprendizaje automático para seleccionar genes pronósticos y construir un modelo predictivo.
- Análisis de enriquecimiento del conjunto de genes (GSEA), análisis de infiltración de células inmunes y predicción de sensibilidad a fármacos.
Principales resultados:
- Se identificaron 109 genes candidatos mediante la intersección de DEG y LRG, seleccionando en última instancia ZIC2, CD24, CEBPD y CCL19 como marcadores pronósticos.
- Desarrolló un modelo de pronóstico validado con una fuerte capacidad predictiva, confirmado por un nomograma.
- Se descubrió que estos genes influyen en el ciclo celular, las vías del ligando EGFR y las células inmunes, con posibles objetivos farmacológicos identificados.
Conclusiones:
- Se identificaron y validaron con éxito cuatro genes pronósticos (ZIC2, CD24, CEBPD, CCL19) en el cáncer de mama.
- Estos genes representan nuevos objetivos prometedores para el desarrollo de estrategias diagnósticas y terapéuticas para la BC.

