Descifrar la resistencia a la vancomicina en Enterococcus faecium: distribución de genes, tipificación de secuencias...

Área de la Ciencia:

• Microbiología
• La genómica
• Epidemiología

Sus antecedentes:

• Enterococcus faecium es un patógeno oportunista significativo.
• La resistencia a la vancomicina en E. faecium representa una gran amenaza para la salud pública.
• Comprender la base genética y la propagación de los genes de resistencia a la vancomicina (van) es fundamental.

Objetivo del estudio:

• Para analizar la prevalencia global y la distribución de los genes van en E. faecium.
• Investigar las relaciones genéticas y las características epidemiológicas de las cepas portadoras de E. faecium.
• Identificar los genotipos y los tipos de secuencia más frecuentes.

Principales métodos:

• Se han descargado y filtrado 3.256 secuencias del genoma de E. faecium, conservando 2.235.
• Los genomas examinados para los genes van usando blastn.
• Determinación de los tipos de secuencia (ST) mediante el uso de perfiles pubMLST.

Principales resultados:

• 1.071 de 2.235 (47,9%) genomas de E. faecium albergaban genes de las van.
• Se identificaron ocho genotipos van, con vanA, vanB, vanD y vanM que representan el 47,6%.
• ST17 fue el ST más prevalente entre las cepas portadoras de van, predominantemente aislado de humanos en los Estados Unidos, siendo vanA el gen más común en 2015.

Conclusiones:

• Los genes Van están ampliamente distribuidos en E. faecium a nivel mundial.
• Las poblaciones humanas y los entornos clínicos muestran una prevalencia significativa de E. faecium.
• Las estrategias de seguimiento e intervención dirigidas a la propagación de las cepas ST17 son esenciales.