Establecimiento del paisaje superpotenciador en el tejido adiposo del pollo

Área de la Ciencia:

• La genómica
• Biología molecular
• Ciencias de los animales

Sus antecedentes:

• Los súper potenciadores (SE) son críticos para la identidad celular y juegan un papel importante en el desarrollo de la grasa de los mamíferos.
• Las SE específicas de los adipocitos de pollo no se han estudiado exhaustivamente a nivel de todo el genoma.
• La comprensión de las EAS es crucial para comprender la adipogénesis y la deposición de grasa en el pollo.

Objetivo del estudio:

• Caracterizar sistemáticamente las EAS en el tejido adiposo del pollo a nivel de todo el genoma.
• Identificar los genes y las vías reguladoras asociadas con ASSE en pollos.
• Explorar el papel de las ASSE en la deposición de grasa de pollo y los rasgos relacionados.

Principales métodos:

• Utilizado el Clivado Bajo Objetivos y la Tagmentación (CUT&Tag) para el perfil de unión de H3K4me1, H3K27ac y PPARγ en el tejido adiposo de pollo.
• Datos integrados de CUT&Tag para la identificación de ASSE y genes asociados (ASSEAG).
• Se realizó el enriquecimiento funcional, el análisis de la expresión génica, el análisis del sitio de unión del factor de transcripción y el análisis cuantitativo de los loci de los rasgos (QTL).

Principales resultados:

• Se identificaron 278 ASSE asociadas con 1.129 genes (ASSEAGs) en el tejido adiposo de pollo.
• Los ASSEAG están involucrados en vías de señalización cruciales como PI3K-Akt, PPAR, Hippo y JAK-STAT.
• 93 ASSEAG se superponen con genes expresados diferencialmente en líneas seleccionadas de pollos de engorde, y las ASSE se superponen con 1.125 QTL relacionados con rasgos de pollo.

Conclusiones:

• Proporciona la primera caracterización completa de todo el genoma de ASSE de pollo.
• Destaca la importancia de las ASSE en la regulación de la adipogénesis y el desarrollo del tejido adiposo en pollos.
• Ofrece nuevos conocimientos sobre los mecanismos moleculares que rigen la deposición de grasa de pollo y los rasgos relacionados.