Ensamblaje del genoma a nivel cromosómico de Trichogramma japonicum (Hymenoptera: Trichogrammatidae)

Área de la Ciencia:

• Entomología
• La genómica
• Ciencias Agrícolas

Sus antecedentes:

• El Trichogramma japonicum es vital para controlar los perforadores del tallo del arroz como el Chilo suppressalis.
• Las investigaciones anteriores estaban limitadas por la ausencia de un ensamblaje del genoma de T. japonicum.

Objetivo del estudio:

• Para ensamblar un genoma de nivel cromosómico de T. japonicum.
• Proporcionar una base genómica para mejorar la eficiencia parasitaria y comprender las interacciones huésped-parásito.

Principales métodos:

• Utilizó la secuenciación HiFi y la tecnología Hi-C para el ensamblaje del genoma.
• Se ha realizado un análisis BUSCO para la evaluación de la integridad.
• Genes codificadores de proteínas anotados y secuencias repetitivas.

Principales resultados:

• Reunió un genoma a nivel cromosómico de 216.96 Mb para T. japonicum.
• 98,09% de los contigs están anclados a cinco cromosomas con un andamio N50 de 40,53 Mb.
• Se identificaron 16.894 genes codificadores de proteínas y se caracterizaron las secuencias repetitivas (26,45%).

Conclusiones:

• El ensamblaje del genoma de T. japonicum de alta calidad es un recurso valioso para la genómica comparativa.
• Este marco genómico facilita la investigación futura sobre las interacciones huésped-parásito y las estrategias de control de plagas.