La secuenciación del genoma completo y la clasificación filogenética aceleran la implementación de la vigilancia...

Área de la Ciencia:

• Virología
• La genómica
• Salud pública

Sus antecedentes:

• La secuenciación del genoma completo (WGS) es crucial para el estudio de enfermedades infecciosas y el seguimiento de la evolución viral.
• La vigilancia genómica del virus sincitial respiratorio (VSR) proporciona información sobre la diversidad viral y la dinámica evolutiva.
• Los ensayos de PCR multiplex son herramientas valiosas para la secuenciación de patógenos en las iniciativas de vigilancia.

Objetivo del estudio:

• Desarrollar y optimizar los ensayos de PCR de tiling múltiple para la secuenciación eficiente de los genomas del virus sincitial respiratorio A (RSVA) y B (RSVB).
• Permitir la adquisición rápida y rentable de datos genómicos de alta calidad para RSVA y RSVB.
• Apoyar la vigilancia genómica y el monitoreo de los aislados de RSV circulantes para la vacuna y la eficacia terapéutica.

Principales métodos:

• Desarrollo y optimización de ensayos de PCR de azulejos múltiplex para RSVA y RSVB.
• Generación de genomas virales casi completos a partir de muestras clínicas.
• Análisis filogenético de las secuencias de todo el genoma y de las secuencias de los genes de la glicoproteína (G).

Principales resultados:

• Los ensayos desarrollados generaron con éxito genomas RSVA y RSVB casi completos de la mayoría de las muestras probadas.
• El análisis filogenético utilizando genomas enteros mostró grupos de linaje idénticos a las secuencias de genes G, pero ofreció una mayor discriminación.
• Se identificaron mutaciones en la proteína de fusión que podrían afectar la vacuna actual y la eficacia terapéutica antiviral.

Conclusiones:

• Los ensayos de PCR de azulejos múltiplex facilitan WGS de alto rendimiento del RSV, mejorando las capacidades de vigilancia genómica.
• Los análisis genómicos completos que utilizan WGS apoyan las estrategias de salud pública para el desarrollo y despliegue de vacunas y medicamentos antivirales.
• Los ensayos desarrollados proporcionan un método sólido para generar datos genómicos críticos para la investigación del VSR y la salud pública.