Diversidad genómica de Escherichia coli uropatógeno en aislamientos clínicos de seis países latinoamericanos, 2018-2023
- Francesca Caballero 1, Anne Martinez-Ventura 1,2, Diego Cuicapuza 1,3, Alex Fajardo-Loyola 4, Rosmery Gutierrez-Ajalcriña 5, Javier Soto-Pastrana 6, Percy Asmat-Marrufo 7, Evelyn Barco-Yaipen de Vera 8, Henry Meza-Fernandez 9, Mario Chambi-Quispe 10, Jimena Pino-Dueñas 11, Nicomedes Laura-Rivas 12, Alexander Briones-Alejo 13, Pilar Diaz-Rengifo 14, Carlos Peralta-Siesquen 15, Guillermo Salvatierra 1, Pablo Tsukayama 1,16, Pool Marcos-Carbajal 1,17
- Francesca Caballero 1, Anne Martinez-Ventura 1,2, Diego Cuicapuza 1,3
- 1Universidad Peruana Cayetano Heredia, Laboratorio de Genómica Microbiana, Lima, Perú.
- 2Emerge (Emerging Diseases and Climate Change Research Unit), Facultad de Salud Pública y Administración, Universidad Peruana Cayetano Heredia, Lima, Perú.
- 3Facultad de Medicina, Universidad Peruana Cayetano Heredia, Lima, Perú.
- 4Instituto Nacional de Salud, Centro Nacional de Salud Pública, Laboratorio de Biotecnología y Biología molecular, Lima, Perú.
- 5Hospital de Huaycán, Área de Epidemiología, Lima, Perú.
- 6Hospital Nacional Docente Madre Niño San Bartolomé, Departamento de Patología Clínica, Área de Microbiología, Lima, Perú.
- 7Laboratorio de Referencia Regional Salud Pública, Servicio de microbiología, Trujillo, La Libertad, Perú.
- 8Hospital JAMO, Área de microbiología, Tumbes, Perú.
- 9Hospital Alberto Sabogal Sologuren, Departamento de Patología Clínica, Servicio de Microbiología, Bellavista, Callao, Perú.
- 10Hospital Carlos Monge Medrano, Patología Clínica, Puno, Perú.
- 11Hospital Regional del Cusco, Patología Clínica, Cusco, Perú.
- 12Laboratorio de Referencia Regional de Salud Pública Huancavelica, Servicio de microbiología, Huancavelica, Perú.
- 13Hospital Regional de Loreto, Servicio de microbiología, Iquitos, Perú.
- 14Laboratorio de Referencia Regional Salud Pública San Martín, Servicio de Microbiología, Tarapoto, Perú.
- 15IPRESS Jorge Chávez, Área de microbiología, Madre de Dios, Perú.
- 16Instituto de Medicina Tropical Alexander von Humboldt, Universidad Peruana Cayetano Heredia, Lima, Perú.
- 17Universidad Peruana Unión, Escuela Profesional Medicina, Laboratorio de Investigación en Biología Molecular, Lima, Perú.
- 0Universidad Peruana Cayetano Heredia, Laboratorio de Genómica Microbiana, Lima, Perú.
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Resumen
Este resumen es generado por máquina.Los clones de Escherichia coli uropatógenos de alto riesgo (UPEC), incluidos ST131 y ST1193, son frecuentes en América Latina. El análisis genómico reveló mutaciones críticas que confieren resistencia a múltiples fármacos, lo que subraya la necesidad de una vigilancia reforzada.
Área De La Ciencia
- Microbiología
- La genómica
- Salud pública
Sus Antecedentes
- Necesidad urgente de vigilancia genómica de la Escherichia coli uropatógena (UPEC) en América Latina debido al aumento de la resistencia a los antimicrobianos en las infecciones del tracto urinario (ITU).
- Creciente preocupación por la salud pública con respecto a la eficacia de los tratamientos antimicrobianos contra la UPEC.
Objetivo Del Estudio
- Caracterizar genéticamente los aislamientos clínicos de UPEC de Perú.
- Para contextualizar los genomas UPEC peruanos con otros genomas UPEC latinoamericanos (2018-2023).
Principales Métodos
- Secuenciación y ensamblaje de 16 aislamientos de UPEC peruanos.
- Complementación con 127 genomas públicos de la UPEC de América Latina.
- Identificación de serotipos, tipos de secuencia (ST), genes de resistencia a los antimicrobianos (AMR) y mutaciones.
- Análisis filogenético para determinar las relaciones evolutivas y la distribución de los filogrupos.
Principales Resultados
- ST131 (42,7%) y ST1193 (13,3%) fueron los clones UPEC de alto riesgo más prevalentes.
- El filogrupo B2 fue predominante (83,2%), siendo notable el serotipo O25: H4.
- Alta frecuencia de los genes de resistencia (blaTEM-1, blaCTX-M-15, blaCTX-M-27) y las mutaciones de resistencia a las fluoroquinolonas (gyrA, parC), especialmente en ST131.
Conclusiones
- Prevalencia alta de clones UPEC de alto riesgo (ST131, ST1193) en América Latina.
- Se identificó una carga significativa de genes y mutaciones multirresistentes.
- Necesidad urgente de mejorar la vigilancia genómica regional de la UPEC para informar las estrategias de tratamiento.
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