Información toxicológica de la red sobre la exposición al DEHP y el desarrollo y la progresión del cáncer de tiroides

Área de la Ciencia:

• Toxicología ambiental
• En el campo de la oncología
• La bioinformática

Sus antecedentes:

• El di-2-etilhexil ftalato (DEHP) es un contaminante ambiental con vínculos potenciales con varios tipos de cáncer.
• El cáncer de tiroides es un problema de salud mundial importante, que requiere la identificación de nuevos biomarcadores para el diagnóstico y el pronóstico.

Objetivo del estudio:

• Identificar los marcadores moleculares asociados con la exposición al di-2-etilhexil ftalato (DEHP) y su correlación con la incidencia y el pronóstico del cáncer de tiroides.
• Integrar la toxicología de red y los enfoques de acoplamiento molecular para el descubrimiento de biomarcadores.
• Validar los marcadores identificados utilizando conjuntos de datos disponibles públicamente.

Principales métodos:

• Utilizó los conjuntos de datos del Atlas del Genoma del Cáncer (TCGA-THCA) y del Ómnibus de Expresión Génica (GEO) para la expresión génica y los datos clínicos.
• Se realizó un análisis del diagrama de Venn para identificar genes superpuestos entre los objetivos de DEHP y los conjuntos de datos de cáncer de tiroides.
• Se han realizado análisis de enriquecimiento de vías de la Enciclopedia de Genes y Genomas de Kioto (KEGG) y de la Ontología de Genes (GO).
• Se emplearon análisis multivariados de regresión de COX y de supervivencia de Kaplan-Meier para la identificación del gen hub y la evaluación del pronóstico.
• Se han validado los genes candidatos utilizando las curvas de las características operativas del receptor (ROC).
• Aplicación de acoplamiento molecular para visualizar las interacciones entre el DEHP y los genes objetivo identificados.

Principales resultados:

• Se identificaron seis genes que se superponen (CYP1B1, ABCC3, KRT19, CUX2, GABRB2, TNFSF15).
• CYP1B1, GABRB2 y TNFSF15 fueron confirmados como genes candidatos con una alta expresión significativa.
• La alta expresión de estos genes hub se correlacionó con un pronóstico significativamente peor en pacientes con cáncer de tiroides (p < 0,05).
• Las curvas de ROC pronóstico indicaron un fuerte potencial de diagnóstico para CYP1B1, GABRB2 y TNFSF15 (AUC > 0,86).
• El acoplamiento molecular visualizó las interacciones directas entre el DEHP y sus genes diana.

Conclusiones:

• CYP1B1, GABRB2 y TNFSF15 se identifican como marcadores moleculares significativos asociados con el desarrollo y la progresión del cáncer de tiroides bajo exposición a DEHP.
• Estos genes representan posibles nuevos objetivos terapéuticos para la intervención del cáncer de tiroides.
• El estudio pone de relieve la utilidad de integrar la toxicología en red y la bioinformática para la investigación de la salud ambiental.