Evaluación de la secuenciación dirigida de próxima generación para el diagnóstico microbiológico de la infección...

Área de la Ciencia:

• Microbiología
• Enfermedades infecciosas
• La genómica

Sus antecedentes:

• Las infecciones agudas de las vías respiratorias inferiores (IRAP) representan un importante desafío para la salud mundial.
• La identificación precisa y rápida del patógeno es crucial para un tratamiento clínico eficaz.
• Las pruebas microbiológicas convencionales (CMT) tienen limitaciones en cuanto a sensibilidad y tiempo de detección.

Objetivo del estudio:

• Evaluar el rendimiento diagnóstico de la secuenciación dirigida de próxima generación (tNGS) para la detección de patógenos en pacientes con ALRI.
• Comparar la sensibilidad, la puntualidad y la rentabilidad de los tNGS con los CMT.

Principales métodos:

• Un estudio retrospectivo en el que participaron 968 pacientes con ALRI.
• Se analizaron muestras de esputo o lavado broncoalveolar utilizando tNGS y CMTs (cultivo, tinción, PCR, RT-PCR).
• Se registraron el tiempo y los costes de detección para ambos métodos.

Principales resultados:

• tNGS identificó un mayor número de patógenos bacterianos, fúngicos y virales, incluidas especies específicas como *Mycoplasma pneumoniae* y *Chlamydia psittaci*.
• Se observaron tasas de detección positiva significativamente más altas con el tNGS en comparación con los CMT.
• tNGS demostró una alta consistencia con pruebas moleculares específicas (por ejemplo, para la influenza A, COVID-19) y ofreció ventajas en el tiempo y costo de detección.

Conclusiones:

• tNGS exhibe una sensibilidad superior para la detección de un amplio espectro de patógenos en ALRI.
• El método es oportuno y rentable, presentando una alternativa prometedora a los diagnósticos convencionales.
• tNGS puede ayudar a orientar las decisiones clínicas de diagnóstico y tratamiento de infecciones respiratorias.