El panorama de las asociaciones microbianas en el cáncer humano

Área de la Ciencia:

• En el campo de la oncología
• Microbiología
• La genómica

Sus antecedentes:

• Se estima que los microbios oncogénicos contribuyen al 15% de los cánceres en todo el mundo.
• La secuenciación del genoma completo (WGS) de pacientes con cáncer permite el análisis simultáneo del ADN del huésped y del microbiano.
• Comprender el papel del microbioma tumoral es crucial para la etiología del cáncer y el manejo clínico.

Objetivo del estudio:

• Investigar las comunidades microbianas en diversos tipos de cáncer utilizando datos del SGD.
• Identificar las firmas microbianas específicas del cáncer y su potencial relevancia clínica.
• Evaluar la utilidad del análisis microbiano en el diagnóstico y pronóstico del cáncer.

Principales métodos:

• Análisis de datos de WGS de 8908 pacientes en 22 tipos de cáncer del conjunto de datos de Genomics England.
• Validación de los resultados en dos cohortes de pacientes independientes.
• Comparación de la detección microbiana con las normas clínicas actuales para patógenos específicos.

Principales resultados:

• Los tumores colorrectales mostraron comunidades microbianas únicas, lo que permitió una distinción anatómica confiable del sitio (PPV = 0,95).
• Se logró una detección precisa de los alfa- papilomavirus (virus del papiloma humano) en los cánceres orales.
• Se identificaron asociaciones entre las bacterias anaerobias y la supervivencia en los subtipos de sarcoma (P < 0,05).
• Los resultados desafían la noción de firmas microbianas universalmente distintas para cada tipo de cáncer.

Conclusiones:

• El análisis microbiano muestra un potencial significativo para tipos específicos de cáncer, particularmente el cáncer colorrectal.
• Los datos microbianos derivados de WGS pueden ayudar en la detección de patógenos y potencialmente informar a los marcadores de pronóstico.
• Se justifica una mayor investigación sobre el microbioma tumoral a medida que el WGS se integra más en la práctica clínica.