El método genómico basado en SELEX identifica 350 promotores específicos de SigA en Mycobacterium tuberculosis

Área de la Ciencia:

• Microbiología
• Biología molecular
• La genómica

Sus antecedentes:

• La regulación genética en Mycobacterium tuberculosis por factores sigma, particularmente sigmaA (SigA), no se entiende bien.
• La identificación de los sitios de unión a SigA es crucial para descifrar el control de transcripción en este patógeno.

Objetivo del estudio:

• Identificar nuevos sitios de unión de SigA en el Mycobacterium tuberculosis.
• Investigar las funciones funcionales de estos sitios de unión en la regulación génica.
• Para caracterizar la arquitectura del promotor utilizada por SigA.

Principales métodos:

• Se empleó una evolución genómica sistemática modificada de los ligandos por enriquecimiento exponencial (SELEX) - Seq.
• Para la validación se utilizaron el ensayo de movilidad electroforética por desplazamiento (EMSA) y los ensayos de repetición.
• Análisis bioinformático de secuencias de ADN identificadas y sus ubicaciones genómicas.

Principales resultados:

• Se identificaron 350 nuevos sitios de unión de SigA en M. tuberculosis.
• 38 sitios en regiones intergénicas sugieren nuevos promotores de SigA.
• 312 sitios en regiones intragénicas indican funciones reguladoras previamente desconocidas, incluida la síntesis de 62 transcripciones y 14 ARN no codificantes, y la identificación de 88 nuevas proteínas.
• El análisis reveló diversos elementos promotores, con 128 sitios que contienen solo elementos similares a -35, lo que desafía los modelos convencionales de promotores bacterianos.

Conclusiones:

• El estudio amplía el panorama conocido de la regulación genética mediada por SigA en M. tuberculosis.
• Los sitios de unión de SigA intragénicos juegan un papel importante en la transcripción y en las funciones reguladoras potencialmente nuevas.
• La arquitectura del promotor en M. tuberculosis se desvía de los conceptos generales de promotor bacteriano, lo que requiere una mayor investigación de sus estrategias reguladoras únicas.