De los paneles a las redes de patógenos: el papel creciente de la secuenciación específica en medicina veterinaria

Área de la Ciencia:

• Microbiología veterinaria
• La genómica
• Secuenciación de próxima generación (NGS)

Sus antecedentes:

• La secuenciación dirigida ofrece ventajas para la detección de patógenos animales.
• Se enriquece selectivamente regiones genómicas específicas para el análisis.

Objetivo del estudio:

• Revisar los principios de secuenciación específica y las estrategias de enriquecimiento.
• Explorar aplicaciones en el diagnóstico veterinario, incluida la detección de patógenos y la vigilancia de la resistencia a los antimicrobianos.
• Identificar las limitaciones y las direcciones futuras para la secuenciación específica en la salud animal.

Principales métodos:

• Revisión sistemática de los principios de secuenciación dirigida.
• Análisis de las estrategias de enriquecimiento: amplificación por PCR, hibridación de sondas, sistemas CRISPR-Cas.
• Evaluación de las aplicaciones en el diagnóstico de ganado, vigilancia genética de la AMR y tipificación de patógenos.

Principales resultados:

• La secuenciación dirigida permite una detección de patógenos múltiple de alto rendimiento, sensible y rentable.
• Eficaz para identificar infecciones mixtas y patógenos de baja abundancia en el ganado.
• Las limitaciones incluyen la incompletitud de la base de datos de referencia y los desafíos de rentabilidad.

Conclusiones:

• La secuenciación dirigida es una herramienta poderosa para el diagnóstico veterinario y la iniciativa "Una sola salud".
• Los desarrollos futuros incluyen el diseño de paneles de IA y la integración multi-ómica para una mayor escalabilidad y precisión.
• Abordar las limitaciones actuales es crucial para una adopción más amplia en los laboratorios primarios.