Rendimiento diagnóstico de secuenciación de exomas enteros en una cohorte de 825 pacientes

Área de la Ciencia:

• La genética
• Diagnóstico médico
• Medicina genómica

Sus antecedentes:

• Las enfermedades raras presentan problemas de diagnóstico.
• La secuenciación de próxima generación (NGS), incluida la secuenciación de exomas enteros (WES), es una herramienta principal para las pruebas genéticas.
• El diagnóstico WES se utiliza cada vez más en entornos clínicos.

Objetivo del estudio:

• Evaluar el rendimiento diagnóstico de la secuenciación del exoma completo (WES) en una gran cohorte de pacientes con enfermedades raras.
• Identificar las características del paciente y las características fenotípicas asociadas con una mayor probabilidad de diagnóstico genético.
• Para evaluar la utilidad de WES en un entorno de diagnóstico del mundo real.

Principales métodos:

• El diagnóstico WES se realizó en 1660 muestras de 825 pacientes (de 0 a 84 años) entre 2014 y 2020.
• Los síntomas de los pacientes se asignaron a los términos de la Ontología del Fenotipo Humano (HPO).
• Las variantes se clasificaron utilizando las directrices de ACMG- AMP.

Principales resultados:

• Se logró un rendimiento de diagnóstico del 33,7%, con 278 pacientes que recibieron un diagnóstico genético.
• Los pacientes con fenotipos complejos que involucran múltiples sistemas de órganos tuvieron un mayor rendimiento diagnóstico.
• Los fenotipos, incluidas las anomalías del crecimiento, del oído y del sistema musculoesquelético, mostraron un mayor éxito diagnóstico.

Conclusiones:

• La secuenciación completa del exoma es una herramienta de diagnóstico eficaz para enfermedades raras, lo que da lugar a diagnósticos significativos.
• Los fenotipos complejos y los términos específicos de HPO son predictivos de un diagnóstico genético exitoso a través de WES.
• El análisis WES proporciona diagnósticos genéticos valiosos para una proporción sustancial de pacientes con enfermedades raras.