Tabula Sapiens revela la expresión del factor de transcripción, los efectos de la senescencia y las características...

Área de la Ciencia:

• La genómica
• Biología celular
• La bioinformática

Sus antecedentes:

• El proyecto Tabula Sapiens proporciona un atlas de referencia transcriptómico integral de una sola célula de células humanas.
• Las versiones anteriores establecieron una base para comprender la heterogeneidad celular en los tejidos.

Objetivo del estudio:

• Ampliar significativamente el atlas de células humanas de Tabula Sapiens con nuevos donantes y tejidos.
• Para analizar la expresión del factor de transcripción, la senescencia celular y los patrones de expresión génica específicos del sexo.
• Desarrollar una herramienta accesible para consultar los antecedentes de salud de los donantes.

Principales métodos:

• Secuenciación de ARN de una sola célula de células de múltiples órganos y tejidos humanos.
• Análisis bioinformático de la expresión del factor de transcripción, los marcadores de senescencia y la expresión génica por sexo.
• Desarrollo de una gran aplicación web basada en modelos de lenguaje para la exploración de datos.

Principales resultados:

• Tabula Sapiens 2.0 duplica el número de células y agrega nuevos tejidos, incluidos los donantes de múltiples órganos para comparaciones controladas.
• Se identificaron la especificidad de tipo celular y las funciones reguladoras para casi todos los factores de transcripción humana.
• Se aclararon los atributos universales y específicos del tipo de órgano / célula de la senescencia celular.
• Se descubrieron perfiles de expresión génica específicos del sexo en varios tipos de células.
• Se creó una aplicación web para la consulta interactiva de los registros de salud de los donantes.

Conclusiones:

• Tabula Sapiens 2.0 representa un gran avance en los recursos del atlas de las células humanas.
• El conjunto de datos ampliado proporciona una resolución sin precedentes para estudiar la regulación genética, el envejecimiento y las diferencias de sexo en las células humanas.
• El análisis integrado ofrece información fundamental sobre los procesos biológicos fundamentales en diversos tipos de células humanas.