Actualización de PRECOG: un recurso aumentado de asociaciones de resultados clínicos con la expresión génica para...

Área de la Ciencia:

• En el campo de la oncología
• La genómica
• La bioinformática

Sus antecedentes:

• Los perfiles de expresión génica sirven como biomarcadores pronósticos y predictivos cruciales en el cáncer.
• La base de datos PRECOG proporciona un recurso valioso para visualizar la expresión génica y las asociaciones de resultados clínicos.

Objetivo del estudio:

• Ampliar la base de datos de PRECOG con nuevos tipos de cáncer en adultos, cohortes pediátricas y datos de pacientes tratados con inmunoterapia.
• Mejorar el descubrimiento de biomarcadores basados en la expresión génica para la supervivencia del paciente y la respuesta al tratamiento.

Principales métodos:

• PRECOG aumentado con nuevas cohortes de adultos, pediátricos (PRECOG) y de inmunoterapia (ICI PRECOG).
• Utilizó Cox y regresión logística para analizar las asociaciones de expresión génica con la supervivencia y la respuesta.
• CIBERSORTx empleado para la desconvolución computacional para estimar las fracciones de tipo celular y sus asociaciones de supervivencia.

Principales resultados:

• Se agregaron conjuntos de datos completos para 12 cánceres pediátricos y 20 subtipos de cáncer tratados con inmunoterapia.
• Se identificaron asociaciones significativas entre la expresión génica, los tipos de células y los resultados de supervivencia en todas las cohortes.
• Hizo que todos los datos, incluidos los puntajes z de supervivencia y las visualizaciones, estuvieran disponibles para análisis interactivo y descarga.

Conclusiones:

• El recurso ampliado de PRECOG ofrece información sin precedentes sobre los biomarcadores del cáncer.
• Facilita el descubrimiento de biomarcadores para terapias específicas, poblaciones de pacientes (incluidos los pediátricos) y tipos de cáncer.
• Permite a los investigadores explorar los perfiles genómicos y su impacto en la supervivencia del paciente y la eficacia del tratamiento.