La Iniciativa del Hologenoma de la Tierra: Publicación de datos 1

Área de la Ciencia:

• Microbiología
• La genómica
• Biología evolutiva
• Ecología

Sus antecedentes:

• La Iniciativa del Hologenoma de la Tierra (EHI) investiga las cuestiones ecológicas y evolutivas.
• Se centra en la relación huésped-microbiota utilizando datos genómicos y metagenómicos integrados.

Objetivo del estudio:

• Generar y analizar datos genómicos y metagenómicos microbianos estandarizados de las articulaciones animales.
• Explorar las cuestiones fundamentales de la ecología y la evolución desde una perspectiva sistémica de microbiota huésped.

Principales métodos:

• Generación estandarizada de datos genómicos conjuntos de animales.
• Análisis de los datos metagenómicos microbianos asociados de diversas especies de vertebrados.
• Reconstrucción de genomas ensamblados por metagenoma.

Principales resultados:

• La primera publicación de datos de la EHI incluye 968 archivos de secuenciación (5,2 TB) de 21 especies de vertebrados en 12 países.
• Se reconstruyeron 17.666 genomas ensamblados por metagenoma a partir de los datos.
• El conjunto de datos representa un recurso importante para los estudios de interacción entre el huésped y la microbiota.

Conclusiones:

• El conjunto de datos EHI es valioso para abordar cuestiones clave en las interacciones entre el huésped y la microbiota.
• Los datos serán accesibles a la comunidad investigadora en condiciones específicas de uso.
• Esta iniciativa hace avanzar la comprensión del concepto de hologenoma.