Perfiles de expresión génica y análisis de vías en pacientes con cariotipo normal de leucemia mieloide aguda

Área de la Ciencia:

• La genómica
• Biología molecular
• En el campo de la oncología

Sus antecedentes:

• La leucemia mieloide aguda con cariotipo normal (AML-NK) muestra una heterogeneidad significativa que afecta los resultados del tratamiento.
• Comprender los fundamentos moleculares de la LMA-NK es crucial para mejorar el tratamiento y la supervivencia de los pacientes.
• La secuenciación del transcriptoma ofrece una herramienta poderosa para explorar perfiles de expresión génica e identificar vías desreguladas en la LMA-NK.

Objetivo del estudio:

• Realizar un análisis exhaustivo del transcriptoma de la LMA-NK en una cohorte de Malasia.
• Identificar genes expresados diferencialmente (DEG) y vías desreguladas en la LMA-NK en el momento del diagnóstico y la remisión.
• Explorar el potencial de los genes y vías identificados para las intervenciones terapéuticas y el seguimiento mínimo de la enfermedad residual.

Principales métodos:

• La secuenciación del transcriptoma se realizó en 51 pacientes con LMA-NK al momento del diagnóstico (DX), 12 en primera remisión (CR1) y 12 controles sanos.
• Se utilizó una tubería DESeq2 personalizada para el análisis de la expresión génica diferencial.
• El análisis de enriquecimiento del conjunto de genes y la validación RT-qPCR se emplearon para analizar la desregulación de la vía y confirmar los hallazgos.

Principales resultados:

• Se identificaron 5.126 DEG entre la LMA-NK y los controles sanos, siendo el 85,8% genes codificantes.
• Se encontraron 5.621 DEG entre las muestras de LMA-NK DX y CR1, afectando a 20 categorías de vías.
• Las vías proliferativas (ciclo celular, replicación del ADN) fueron reguladas al alza, mientras que las vías relacionadas con el sistema inmunológico fueron reguladas al bajo. Se observó sobreexpresión de oncogenes (FLT3, MYB, DNMT3B, MYCN) en el estudio DX vs CR1.

Conclusiones:

• La desregulación transcriptómica se valida en la patogénesis de la LMA-NK, reiterando las características del cáncer.
• Los DEG y las vías identificadas ofrecen información sobre los mecanismos moleculares de la LMA-NK.
• Los oncogenes sobreexpresados sirven como marcadores potenciales para el seguimiento mínimo de la enfermedad residual en la LMA-NK.