El muestreo exhaustivo de genomas mitocondriales justifica el origen neoproterozoico de las plantas terrestres

Área de la Ciencia:

• Biología evolutiva de las plantas
• Filogenética molecular
• La genómica

Sus antecedentes:

• La reconstrucción filogenética de las plantas verdes a menudo muestra incongruencia entre los genes mitocondriales, nucleares y cloroplásticos.
• Los genomas mitocondriales, a pesar de la herencia uniparental, no se utilizan para la estimación del tiempo filogenético y de divergencia debido a las limitaciones percibidas.

Objetivo del estudio:

• Reconstruir la filogenia de las plantas verdes y estimar los tiempos de divergencia utilizando un conjunto de datos completo del genoma mitocondrial.
• Evaluar y mitigar los factores que afectan la precisión filogenética y la estimación del tiempo de divergencia a partir de los datos mitocondriales.

Principales métodos:

• Reunió un conjunto de datos de 565 genomas mitocondriales de todos los principales linajes de plantas verdes.
• Empleó múltiples particiones y modelos filogenéticos para la reconstrucción filogenética.
• Factores de impacto evaluados sistemáticamente, como la heterogeneidad del contenido de GC y el sesgo de uso de codones.
• Se probaron siete estrategias de datación, evaluando la calibración de fósiles y los efectos de la heterogeneidad de la tasa.

Principales resultados:

• Las filogenias mitocondriales apoyan la parafilia para las briófitas y las carófitas.
• Se colocan como hermanas a las traqueófitas, y a las piedras como hermanas a las plantas terrestres.
• Los resultados de la datación indican un origen Neoproterozoico para las plantas terrestres y un origen Triásico para las angiospermas.

Conclusiones:

• Los genomas mitocondriales son valiosos para la inferencia filogenética robusta y la estimación del tiempo de divergencia en las plantas verdes.
• Abordar las estrategias de partición y la heterogeneidad del linaje es crucial para mitigar los errores sistemáticos.
• Este estudio subraya la importancia de los conjuntos de datos completos y los enfoques analíticos rigurosos en la filogenómica vegetal.