Reconstrucción digital de embriones completos durante la organogénesis temprana del ratón

Área de la Ciencia:

• Biología del desarrollo
• La genómica
• Biología computacional

Sus antecedentes:

• La organogénesis temprana es vital para la formación de órganos, pero es vulnerable a los defectos.
• Comprender la expresión génica espacio-temporal es clave para descifrar los procesos de desarrollo.

Objetivo del estudio:

• Crear un modelo de embrión digital en 3D de alta resolución para el estudio de la organogénesis temprana.
• Mapear la expresión génica y las redes de señalización in situ durante el desarrollo embrionario.

Principales métodos:

• El perfil de 285 secciones de serie de los embriones de ratón E7.5-E8.0.
• Desarrollo de SEU-3D para la reconstrucción digital del embrión y la transcriptómica espacial.
• Aplicación de un enfoque de incrustación de genes y células basado en el espacio.

Principales resultados:

• Se han generado mapas espaciotemporales completos del transcriptoma y de la señal a resolución de una sola célula.
• Caracterizó el atlas espacial de los derivados del endodermo y el mesodermo.
• Se identificó una zona de determinación del primordium (PDZ) involucrada en la formación del primordium cardíaco.

Conclusiones:

• El embrión digital proporciona una visión sin precedentes de la organogénesis temprana.
• Esta plataforma espacial facilita el estudio de los mecanismos de desarrollo y las enfermedades.