Un antiguo desierto de recombinación es un supergen de especiación en mamíferos placentarios

Área de la Ciencia:

• Biología evolutiva
• La genómica
• Genética de los mamíferos

Sus antecedentes:

• El flujo genético es un proceso evolutivo común, pero inferir las relaciones de las especies a partir de datos genómicos es un desafío.
• La tasa de recombinación meiótica influye en el flujo genético y la especiación, pero los mapas de recombinación son escasos.

Objetivo del estudio:

• Para inferir la evolución del paisaje de recombinación en los mamíferos placentarios utilizando el aprendizaje profundo.
• Investigar el papel de los patrones de recombinación en la divergencia de las especies y la inferencia filogenética.

Principales métodos:

• Aprendizaje profundo aplicado a las alineaciones del genoma de 22 especies de mamíferos placentarios.
• Se han realizado análisis filogenómicos de recombinación con datos de 94 especies.

Principales resultados:

• Se identificó un gran desierto de recombinación conservado vinculado a X (30% del cromosoma).
• Este desierto actúa como una antigua barrera para el flujo de genes y preserva la historia de las especies durante la introgestión.
• El locus está enriquecido con genes relacionados con el silenciamiento y la reproducción de los cromosomas sexuales.

Conclusiones:

• El desierto de recombinación vinculado a X es un factor significativo en la especiación y el aislamiento reproductivo de los mamíferos.
• Esta región puede servir como un marcador confiable para resolver complejas relaciones filogenéticas de mamíferos.