Conservación de códigos cis-regulatorios durante quinientos millones de años de evolución

Área de la Ciencia:

• Biología evolutiva
• Genómica
• Neurociencia

Sus antecedentes:

• La identificación de tipos celulares homólogos entre especies es crucial para comprender la evolución.
• La retina de los vertebrados, con sus clases celulares conservadas, ofrece un modelo único para estudios comparativos.
• La expresión génica está regulada por códigos cis-regulatorios.

Objetivo del estudio:

• Investigar la conservación de los códigos cis-regulatorios que rigen la expresión génica en la retina de vertebrados entre especies.
• Determinar si la arquitectura celular conservada de la retina se refleja en mecanismos regulatorios conservados.

Principales métodos:

• Se realizó un análisis de accesibilidad de la cromatina de una sola célula en retinas de lamprea, peces, aves y mamíferos.
• Se utilizaron métodos computacionales para identificar patrones conservados de sitios de unión de factores de transcripción y regiones de cromatina abierta.

Principales resultados:

• Se encontró una profunda conservación de los códigos cis-regulatorios en todas las principales clases de células de la retina en las especies estudiadas.
• Esta conservación persiste a pesar de la importante rotación de regiones cis-regulatorias específicas.
• Los patrones conservados implican la agrupación de sitios de unión de factores de transcripción dentro de regiones de cromatina abierta específicas de células.

Conclusiones:

• El plan celular conservado (Bauplan) de la retina de los vertebrados está sustentado por códigos cis-regulatorios profundamente conservados.
• Estos códigos regulatorios son anteriores a la divergencia de las especies de vertebrados existentes, lo que resalta su papel fundamental en el desarrollo y la función de la retina.