Genómica comparativa a gran escala identifica nuevos marcadores de diagnóstico en seis especies de Enterococcus...

Área de la Ciencia:

• Microbiología; Genómica; Diagnóstico Molecular

Sus antecedentes:

• Las especies de Enterococcus, incluidos E. faecalis y E. faecium, son causas importantes de infecciones nosocomiales.; La creciente resistencia y las especies menos comunes exigen métodos de identificación mejorados.

Objetivo del estudio:

• Identificar marcadores genéticos fiables específicos del género y de la especie para Enterococcus.; Desarrollar herramientas de diagnóstico precisas para la identificación y vigilancia de Enterococcus.

Principales métodos:

• Análisis genómico comparativo a gran escala de más de 35.000 genomas de Enterococcus y 1,4 millones de genomas no Enterococcus.; Identificación de genes marcadores específicos del género (rpmC) y específicos de la especie.; Desarrollo y validación de ensayos de PCR dúplex y multiplex.

Principales resultados:

• El gen rpmC se identificó como un marcador específico del género para Enterococcus.; Se descubrieron seis marcadores específicos de especies con alta similitud intraespecífica y baja similitud interespecífica.; Los ensayos de PCR demostraron una precisión del 100% en la identificación de 150 aislamientos clínicos de Enterococcus y 54 cepas no Enterococcus.

Conclusiones:

• Los enfoques ómicos a gran escala pueden descubrir marcadores de diagnóstico robustos.; Los marcadores identificados proporcionan herramientas precisas y fiables para la identificación de especies de Enterococcus.; Estas herramientas son valiosas para el diagnóstico clínico y la vigilancia epidemiológica de las infecciones por Enterococcus.