Jove
Visualize
Contáctanos
JoVE
x logofacebook logolinkedin logoyoutube logo
ACERCA DE JoVE
Visión GeneralLiderazgoBlogCentro de Ayuda JoVE
AUTORES
Proceso de PublicaciónConsejo EditorialAlcance y PolíticasRevisión por ParesPreguntas FrecuentesEnviar
BIBLIOTECARIOS
TestimoniosSuscripcionesAccesoRecursosConsejo Asesor de BibliotecasPreguntas Frecuentes
INVESTIGACIÓN
JoVE JournalMethods CollectionsJoVE Encyclopedia of ExperimentsArchivo
EDUCACIÓN
JoVE CoreJoVE BusinessJoVE Science EducationJoVE Lab ManualCentro de Recursos para ProfesoresSitio de Profesores
Términos y Condiciones de Uso
Política de Privacidad
Políticas

Videos de Conceptos Relacionados

Interactions Between Signaling Pathways01:19

Interactions Between Signaling Pathways

7.1K
Signaling cascades usually lack linearity. Multiple pathways interact and regulate one another, allowing cells to integrate and respond to diverse environmental stimuli.
Convergence and divergence, and cross-talk between signaling pathways
Two distinct signaling pathways can converge on a single functional unit, which may either be a single protein or a complex of proteins. The response is either functionally distinct or synergistic between the two pathways but different from the response...
7.1K
Enzyme-linked Receptors01:00

Enzyme-linked Receptors

85.5K
Enzyme-linked receptors are proteins that act as both receptor and enzyme, activating multiple intracellular signals. This is a large group of receptors that include the receptor tyrosine kinase (RTK) family. Many growth factors and hormones bind to and activate the RTKs.
Neurotrophin (NT) receptors are a family of RTKs, including trkA, trkB, and trkC (tropomyosin-related kinase) receptors. TrkA is specific for nerve growth factor (NGF), neurotrophin-6, and neurotrophin-7. TrkB binds...
85.5K
Multi-Step Reactions02:31

Multi-Step Reactions

8.6K
Chemical reactions often occur in a stepwise fashion involving two or more distinct reactions taking place in a sequence. A balanced equation indicates the reacting species and the product species, but it reveals no details about how the reaction occurs at the molecular level. The reaction mechanism (or reaction path) provides details regarding the precise, step-by-step process by which a reaction occurs. Each of the steps in a reaction mechanism is called an elementary reaction. These...
8.6K
Receptor Tyrosine Kinases01:26

Receptor Tyrosine Kinases

17.7K
Receptor tyrosine kinases or RTKs are membrane-bound receptors that phosphorylate specific tyrosine on protein substrates. RTKs regulate cellular growth, differentiation, survival, and migration. They contain an extracellular ligand binding domain, a transmembrane domain, and a cytosolic tail with intrinsic kinase activity. Several extracellular signaling molecules activate RTKs in one or more ways and relay the signal downstream. Ligands such as platelet-derived growth factor (PDGF) or...
17.7K
Drug Discovery: Overview01:26

Drug Discovery: Overview

10.9K
Drug discovery is a multifaceted process involving extensive screening, testing, and optimization of lead compounds to identify potential new drugs for therapeutic use. It combines several approaches, including screening large numbers of natural products, chemical modification of known active molecules, identification of new drug targets, and rational design based on biological mechanisms and drug-receptor structure. These approaches are carried out in both academic research laboratories and...
10.9K
Radical Reactivity: Overview01:11

Radical Reactivity: Overview

2.6K
Radicals, the highly reactive species, gain stability by undergoing three different reactions. The first reaction involves a radical-radical coupling, in which a radical combines with another radical, forming a spin‐paired molecule. The second reaction is between a radical and a spin‐paired molecule, generating a new radical and a new spin‐paired molecule. The third reaction is radical decomposition in a unimolecular reaction, forming a new radical and a spin‐paired...
2.6K

También podría leer

Artículos Relacionados

Artículos vinculados a este trabajo por autores compartidos, revista y gráfico de citas.

Ordenar por
Same author

Apollo 3: Multi-Species Genome Curation.

bioRxiv : the preprint server for biology·2026
Same author

React-to-Me: A Conversational Interface for Interactive Exploration of the Reactome Pathway Knowledgebase.

Research square·2026
Same author

The Reactome Knowledgebase 2026.

Nucleic acids research·2025
Same author

A policy roadmap for sustainable mass-testing.

Health affairs scholar·2025
Same author

Overture: an open-source genomics data platform.

GigaScience·2025
Same author

Guidelines for gene and genome assembly nomenclature.

Genetics·2025

Video Experimental Relacionado

Updated: Jan 8, 2026

A Web Tool for Generating High Quality Machine-readable Biological Pathways
08:01

A Web Tool for Generating High Quality Machine-readable Biological Pathways

Published on: February 8, 2017

18.4K

React-to-Me: Una interfaz conversacional para la exploración interactiva de la base de conocimientos de vías de

Helia Mohammadi1,2, Fatemeh Almodaresi3, Gregory F J Hogue1

  • 1Ontario Institute for Cancer Research, Toronto, ON M5G 0A3, Canada.

bioRxiv : the preprint server for biology
|December 22, 2025
PubMed
Resumen
Este resumen es generado por máquina.

React-to-Me es un nuevo asistente de IA que facilita la exploración de vías biológicas. Utiliza lenguaje natural para consultar la Base de Conocimientos de Vías de Reactome, garantizando información científica precisa y rastreable.

Palabras clave:
IA conversacionalReactomevías biológicaslenguaje naturalrecuperación aumentada de generaciónbioinformáticabiología computacional

Más Videos Relacionados

A Knowledge Graph Approach to Elucidate the Role of Organellar Pathways in Disease via Biomedical Reports
07:35

A Knowledge Graph Approach to Elucidate the Role of Organellar Pathways in Disease via Biomedical Reports

Published on: October 13, 2023

2.1K
Label-Free Immunoprecipitation Mass Spectrometry Workflow for Large-scale Nuclear Interactome Profiling
11:19

Label-Free Immunoprecipitation Mass Spectrometry Workflow for Large-scale Nuclear Interactome Profiling

Published on: November 17, 2019

16.9K

Videos de Experimentos Relacionados

Last Updated: Jan 8, 2026

A Web Tool for Generating High Quality Machine-readable Biological Pathways
08:01

A Web Tool for Generating High Quality Machine-readable Biological Pathways

Published on: February 8, 2017

18.4K
A Knowledge Graph Approach to Elucidate the Role of Organellar Pathways in Disease via Biomedical Reports
07:35

A Knowledge Graph Approach to Elucidate the Role of Organellar Pathways in Disease via Biomedical Reports

Published on: October 13, 2023

2.1K
Label-Free Immunoprecipitation Mass Spectrometry Workflow for Large-scale Nuclear Interactome Profiling
11:19

Label-Free Immunoprecipitation Mass Spectrometry Workflow for Large-scale Nuclear Interactome Profiling

Published on: November 17, 2019

16.9K

Área de la Ciencia:

  • Bioinformática
  • Biología Computacional
  • Representación del Conocimiento

Sus antecedentes:

  • La Base de Conocimientos de Vías de Reactome ofrece datos curados sobre vías biológicas humanas, pero presenta desafíos de accesibilidad para los no expertos debido a su complejo modelo de datos y búsqueda por palabras clave.
  • La IA conversacional general carece de la especificidad del dominio, la transparencia de la fuente y la fiabilidad fáctica necesarias para la investigación científica.

Objetivo del estudio:

  • Desarrollar un asistente de IA conversacional específico del dominio, React-to-Me, para consultar la Base de Conocimientos de Vías de Reactome utilizando lenguaje natural.
  • Mejorar la accesibilidad y usabilidad de los datos complejos de vías biológicas para una gama más amplia de usuarios.

Principales métodos:

  • Implementación de un enfoque de recuperación aumentada de generación (RAG) híbrido combinado con la generación de modelos de lenguaje restringido.
  • Integración de la búsqueda vectorial semántica con la coincidencia basada en palabras clave para mejorar la precisión de la recuperación.
  • Garantizar que todas las respuestas generadas por IA estén conectadas al contenido curado de Reactome con enlaces directos a las entradas de la base de conocimientos.

Principales resultados:

  • La evaluación comparativa computacional demostró que la recuperación híbrida mejoró significativamente la conexión contextual y la precisión fáctica en comparación con los métodos solo densos.
  • Las evaluaciones de expertos ciegos revelaron que las respuestas conectadas recibieron calificaciones de mayor calidad en cuanto a precisión fáctica, especificidad biológica y profundidad mecanicista.
  • Las encuestas a usuarios indicaron una alta satisfacción con la facilidad de uso de React-to-Me, la fiabilidad de las citas y la precisión fáctica.

Conclusiones:

  • La conexión específica del dominio mejora notablemente la fiabilidad y usabilidad de la IA conversacional para la exploración del conocimiento biológico.
  • React-to-Me ofrece una interfaz transparente, científicamente robusta y fácil de usar para acceder a la información de las vías de Reactome.
  • El sistema desarrollado demuestra el potencial de los asistentes de IA especializados en la investigación científica y la accesibilidad de los datos.