Puntos calientes evolutivos de variación estructural impulsan las diferencias interindividuales en la expresión de...

Área de la Ciencia:

• Genómica
• Transcriptómica
• Biología Molecular

Sus antecedentes:

• El splicing alternativo genera diversidad transcriptómica.
• El splicing intergénico crea transcritos de fusión, que combinan exones de múltiples genes.
• Los transcritos de fusión del cáncer a menudo surgen de reorganizaciones somáticas, pero las contribuciones de la línea germinal se comprenden menos.

Objetivo del estudio:

• Investigar el papel de las variantes estructurales de la línea germinal en la formación de transcritos de fusión.
• Evaluar la contribución de los transcritos de fusión a la variabilidad interindividual en tejidos no cancerosos.
• Caracterizar los transcritos de fusión específicos de los humanos y sus orígenes genómicos.

Principales métodos:

• Análisis de transcritos de fusión a nivel de genoma en 312 muestras de cerebro humano post-mortem (corteza temporal y cerebelo).
• Evaluación del potencial de codificación de proteínas utilizando datos de perfilado de ribosomas.
• Análisis comparativo con genomas de chimpancé y macaco Rhesus.

Principales resultados:

• Se identificaron 1458 transcritos de fusión distintos.
• Se demostró el potencial de codificación de proteínas para muchos transcritos de fusión.
• Se encontraron transcritos de fusión variables predominantemente en puntos calientes de duplicación segmentaria (SD), vinculados a trastornos neurológicos.
• Se confirmaron estos transcritos de fusión variables como específicos de los humanos.

Conclusiones:

• La variación interindividual en la expresión de transcritos de fusión es una fuente significativa y subestimada de diversidad genética.
• Los transcritos de fusión específicos de los humanos de puntos calientes de SD asociados a enfermedades pueden tener implicaciones funcionales.
• Se necesita más investigación para explorar los roles fisiológicos y fisiopatológicos de estos transcritos de fusión variables.