Diversidad genómica y fenotípica entre aislados clínicos de Corynebacterium taxonómicamente ambiguos

Área de la Ciencia:

• Microbiología; Genómica; Enfermedades Infecciosas

Sus antecedentes:

• Las bacterias Corynebacterium son comunes en la piel humana pero pueden causar infecciones.; Se analizaron 56 aislados de diversas infecciones de pacientes.; La identificación inicial por espectrometría de masas fue insuficiente para la asignación a nivel de especie.

Objetivo del estudio:

• Identificar con precisión las especies de Corynebacterium de aislados clínicos utilizando la secuenciación del genoma completo.; Caracterizar la variabilidad genética y fenotípica dentro de estas especies.; Evaluar los patrones de resistencia a los antimicrobianos en aislados clínicos de Corynebacterium.

Principales métodos:

• Se realizó la secuenciación del genoma completo de 56 aislados.; La identificación de especies utilizó hibridación digital de ADN-ADN, ubicación en árboles filogenómicos y Identidad Promedio de Nucleótidos (ANI).; Un subconjunto de 34 cepas se sometió a caracterización bioquímica y pruebas de susceptibilidad antimicrobiana (AST).

Principales resultados:

• Se identificaron 28 especies distintas de Corynebacterium, con 13 aislados que mostraron una asignación de especie ambigua (ANI < 95%).; Dos aislados representan potencialmente nuevas especies (ANI < 90%).; Se observó una resistencia antimicrobiana (RAM) extensa, particularmente resistencia a la clindamicina (64,7%), vinculada a genes de resistencia adquiridos.

Conclusiones:

• Este estudio mejora la comprensión de las especies de Corynebacterium clínicamente relevantes, destacando una diversidad genómica y fenotípica significativa.; Las definiciones de especies actuales pueden necesitar revisión debido a la variabilidad observada.; Los altos niveles de RAM podrían complicar el tratamiento de infecciones, aunque el papel patógeno de estos aislados sigue siendo incierto.