Biomarcadores

Área de la Ciencia:

• Bioquímica
• Gerontología
• Proteómica

Sus antecedentes:

• El envejecimiento y las enfermedades humanas se modelan cada vez más utilizando marcos multiorgánicos.
• La proteómica plasmática es una herramienta clave para predecir la edad biológica, produciendo la brecha de edad biológica basada en proteomas (ProtBAG).
• Este estudio utiliza la proteómica del líquido cefalorraquídeo (LCR) para expandir los relojes de envejecimiento específicos de órganos.

Objetivo del estudio:

• Derivar 11 brechas de edad biológica basadas en proteomas específicas de órganos (ProtBAGs) utilizando datos de proteómica de LCR.
• Aplicar dos métodos distintos de aprendizaje automático para desarrollar estos relojes de envejecimiento específicos de órganos.
• Evaluar el rendimiento de los ProtBAGs en diferentes sistemas de órganos.

Principales métodos:

• Se analizaron datos de proteómica de LCR del estudio ADNI (7008 proteínas, 736 participantes).
• Se identificaron proteínas enriquecidas en órganos y se entrenaron dos modelos de aprendizaje automático (SVR lineal y LASSO).
• Se evaluó el rendimiento del modelo utilizando el error absoluto medio (MAE) y el coeficiente de correlación de Pearson (r) mediante validación cruzada.

Principales resultados:

• La imputación de proteómica con una tasa de datos faltantes del 2% arrojó el mejor rendimiento del modelo (r²=0.54).
• Los ProtBAGs cerebrales y hepáticos demostraron los valores más bajos de error absoluto medio (MAE), lo que indica una mayor precisión.
• Los ProtBAGs cerebrales y hepáticos también exhibieron los valores más altos de r de Pearson, lo que confirma un poder predictivo robusto.

Conclusiones:

• Se desarrollaron con éxito 11 ProtBAGs específicos de órganos utilizando proteómica de LCR de la cohorte ADNI.
• Este trabajo mejora el marco existente del reloj de envejecimiento de órganos con información multiorgánica basada en LCR.
• Estudios futuros explorarán los vínculos entre estos nuevos ProtBAGs, la función cognitiva y la progresión de la enfermedad de Alzheimer.