Una perspectiva sobre fragmentos no intencionados y su impacto en el metaboloma oscuro, el perfilado no dirigido, las...

Área de la Ciencia:

• Química Analítica
• Metabolómica
• Espectrometría de Masas

Sus antecedentes:

• Los fragmentos en/post-fuente (ISF) son iones formados durante la espectrometría de masas, lo que complica la interpretación de datos en metabolómica no dirigida.
• Se debate el papel de los ISF en la "materia oscura" (espectros no anotados) y el "metaboloma oscuro" (moléculas no anotadas), lo que afecta la anotación y el descubrimiento de metabolitos.

Objetivo del estudio:

• Proponer una definición refinada del "metaboloma oscuro".
• Proporcionar una visión general sistemática de los ISF y formas iónicas relacionadas (adductos, multímeros).
• Examinar el impacto de los ISF en los flujos de trabajo de metabolómica y la minería de datos.

Principales métodos:

• Revisión de literatura y análisis conceptual de ISF en espectrometría de masas.
• Visión general sistemática de ISF, aductos y multímeros.
• Examen del impacto de ISF en la anotación de metabolitos, el diseño experimental, el análisis estadístico y los flujos de trabajo computacionales.

Principales resultados:

• Los ISF impactan significativamente la precisión de la anotación de metabolitos y la interpretación de los datos de metabolómica no dirigida.
• Las definiciones y flujos de trabajo existentes pueden no tener en cuenta adecuadamente los ISF, lo que lleva a posibles interpretaciones erróneas.
• Una comprensión refinada y un manejo sistemático de los ISF son cruciales para avanzar en la investigación de metabolómica.

Conclusiones:

• Refinar la definición del "metaboloma oscuro" y comprender los ISF son esenciales para una metabolómica rigurosa.
• Se proporcionan recomendaciones prácticas para investigadores y revisores para mitigar los desafíos relacionados con los ISF.
• Abordar los ISF mejora la capacidad del campo para explorar el espacio molecular desconocido y desbloquear nuevos descubrimientos.