Estudios de asociación en todo el genoma y de transcriptoma identifican genes candidatos que regulan la deposición de...

Área de la Ciencia:

• Genética Animal
• Genómica
• Biología Molecular

Sus antecedentes:

• La deposición de grasa perirrenal afecta significativamente la calidad de la canal y el valor económico de las ovejas.
• Comprender la base genética de la deposición de grasa es crucial para mejorar la producción ganadera.

Objetivo del estudio:

• Identificar genes clave y variaciones genéticas que regulan la deposición de grasa perirrenal en ovejas Hu.
• Explorar los mecanismos moleculares subyacentes a la deposición de grasa utilizando enfoques multiómicos.

Principales métodos:

• Estudio de asociación en todo el genoma (GWAS) y análisis de transcriptoma comparativo (RNA-Seq).
• Análisis de redes de coexpresión génica ponderada (WGCNA) e identificación de genes específicos del tejido (TSG).
• PCR cuantitativa en tiempo real (qRT-PCR) para validación y análisis de asociación de mutaciones génicas.

Principales resultados:

• Los estudios de asociación en todo el genoma (GWAS) identificaron polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) significativos cerca de SETD4, TIMP2, SOCS3 y DNAH17.
• El análisis del transcriptoma reveló 2072 genes expresados diferencialmente (DEGs) relacionados con el metabolismo de los lípidos.
• Se descubrió que las mutaciones en TIMP2 y DNAH17 estaban significativamente asociadas con los rasgos de deposición de grasa perirrenal.

Conclusiones:

• Se identifican TIMP2 y DNAH17 como genes clave que influyen en la deposición de grasa perirrenal en ovejas.
• Estos genes y sus mutaciones pueden servir como marcadores potenciales para la selección asistida por marcadores con el fin de mejorar la calidad de la canal.