MoSAIC: Un flujo de trabajo integrado y modular para el análisis seguro de paisajes de modificación postraduccional...

Área de la Ciencia:

• Proteómica
• Biología Molecular
• Bioquímica

Sus antecedentes:

• La investigación de múltiples modificaciones postraduccionales (PTM) de proteínas es crucial para comprender la regulación de proteínas.
• El análisis simultáneo de diversas PTM es un desafío debido a las limitaciones en el rendimiento, la sensibilidad y la reproducibilidad, especialmente con cantidades limitadas de muestra.

Objetivo del estudio:

• Desarrollar un flujo de trabajo robusto y eficiente para el análisis simultáneo de múltiples PTM.
• Abordar las limitaciones de los flujos de trabajo de proteómica existentes para el análisis de PTM múltiples.

Principales métodos:

• Desarrollo de MoSAIC, un flujo de trabajo de PTM múltiples que integra co-enriquecimiento, multiplexación, fraccionamiento, adquisición de datos híbrida y análisis de datos unificado.
• Fosforilación, glicosilación, acetilación y ubiquitinación dirigidas para interrogación simultánea.
• Utilización de fraccionamiento y etiquetado con etiqueta en tándem de masas (TMT) para identificación y cuantificación concurrentes.

Principales resultados:

• MoSAIC duplica la cobertura de PTM (4 frente a 2 PTM) en comparación con el flujo de trabajo tradicional CPTAC dentro del mismo tiempo de instrumento (24 ejecuciones de MS).
• Se logró un aumento en las identificaciones de péptidos modificados por PTM.
• Mejora de la producción y la consistencia de los datos a través de la identificación y cuantificación concurrentes.

Conclusiones:

• MoSAIC proporciona una plataforma rentable y eficiente para el análisis integral de PTM múltiples.
• Este flujo de trabajo supera las limitaciones clave en la proteómica de PTM múltiples, avanzando en la investigación biológica y clínica.