MedicalDataHandler, una interfaz gráfica de usuario orientada a la investigación para la gestión de datos DICOM

Área de la Ciencia:

• Informática de imágenes médicas
• Investigación en radioterapia
• Aprendizaje automático en atención médica

Sus antecedentes:

• El procesamiento de datos DICOM (Imágenes Médicas Digitales y Comunicaciones en Medicina) para la investigación es complejo debido a las sutilezas del formato y las excepciones específicas del paciente.
• Requiere una experiencia técnica significativa y un manejo cuidadoso de los datos para mantener la fidelidad para las aplicaciones posteriores.

Objetivo del estudio:

• Se desarrolló MedicalDataHandler para simplificar la lectura, visualización y procesamiento de datos DICOM.
• El objetivo es reducir la dependencia de habilidades avanzadas de codificación y promover el manejo de datos reproducible sin scripts personalizados.

Principales métodos:

• Implementado en Python usando Dear PyGui, organizando archivos DICOM por UID (Identificadores Únicos) de paciente.
• Presenta visualización interactiva 2D/3D, edición sobre la marcha de segmentación y orientación de datos, y conversión rápida al formato NRRD.
• Incluye inspección de metadatos, remuestreo, mapeo de Unidades de Hounsfield y funcionalidades de cálculo de dosis.

Principales resultados:

• Validado con 61 conjuntos de datos de pacientes de radioterapia, optimizando el flujo de trabajo al eliminar la necesidad de codificación específica del paciente.
• Se preparó con éxito un conjunto de datos listo para la investigación para entrenar un modelo de predicción de dosis basado en aprendizaje profundo.
• Se demostró una preparación de datos acelerada para la investigación.

Conclusiones:

• MedicalDataHandler gestiona eficientemente los datos DICOM, acelerando el preprocesamiento para la investigación y la educación.
• Su interfaz fácil de usar y sus capacidades de conversión rápida empoderan a una audiencia más amplia para un manejo de datos médicos consistente y eficiente.