Análisis genómico revela señales de selección de domesticación en pollos de cola larga de Bashang

Área de la Ciencia:

• Genómica
• Genética Animal
• Biología Evolutiva

Sus antecedentes:

• La comprensión de la domesticación de los pollos proporciona información sobre la adaptación animal.
• Los pollos de cola larga de Bashang representan una raza única con posibles distinciones genéticas.

Objetivo del estudio:

• Elucidar la diferenciación genética y los mecanismos de selección de la domesticación en pollos de cola larga de Bashang en comparación con su ancestro salvaje, la gallina roja salvaje.
• Identificar regiones genómicas y genes bajo selección durante la domesticación.

Principales métodos:

• Análisis comparativo de genoma completo.
• Análisis de desequilibrio de ligamiento (LD) y análisis de estructura de población genética (árboles de vecino más cercano, análisis de componentes principales, mezcla).
• Análisis de barrido selectivo utilizando el índice de fijación, la D de Tajima y la relación de diversidad nucleotídica.

Principales resultados:

• Los pollos de cola larga de Bashang exhiben una desintegración más lenta del desequilibrio de ligamiento (LD), lo que indica una reducción de la recombinación genómica por selección artificial.
• Se observó una diferenciación genética significativa entre los pollos de cola larga de Bashang y la gallina roja salvaje.
• Se identificaron 102 regiones de barrido selectivo y 22 genes candidatos, incluidos ALX1, RASSF9 y NTS con mutaciones adaptativas.

Conclusiones:

• Se identificaron firmas genómicas de adaptación impulsada por la domesticación en pollos de cola larga de Bashang.
• Los genes seleccionados se enriquecen en vías de metabolismo de carbohidratos/proteínas y regulación neural.
• Los hallazgos ofrecen marcadores moleculares para la conservación de los recursos genéticos de los pollos y para la cría molecular.