PeptiVerse: Una plataforma unificada para la predicción de propiedades de péptidos terapéuticos

Área de la Ciencia:

• Biotecnología
• Química Computacional
• Descubrimiento de Fármacos

Sus antecedentes:

• Los péptidos terapéuticos ofrecen ventajas sobre las moléculas pequeñas y los anticuerpos, incluida la flexibilidad de los objetivos y la baja inmunogenicidad.
• Sin embargo, su desarrollo exitoso requiere una evaluación integral de múltiples propiedades más allá de la simple afinidad de unión.
• Los métodos actuales carecen de una plataforma unificada para evaluar las propiedades de las secuencias peptídicas canónicas y las estructuras peptídicas modificadas químicamente (SMILES).

Objetivo del estudio:

• Presentar PeptiVerse, una plataforma universal para predecir propiedades de desarrollabilidad de péptidos terapéuticos.
• Proporcionar un enfoque unificado para la evaluación de propiedades a través de diversas representaciones de péptidos.
• Apoyar los flujos de trabajo de diseño generativo y desarrollo en etapas tempranas para terapéuticos peptídicos.

Principales métodos:

• Aprovechamiento de grandes modelos fundacionales entrenados en datos de proteínas y químicos.
• Desarrollo de una plataforma que acepta tanto secuencias de aminoácidos como representaciones basadas en SMILES de péptidos modificados químicamente.
• Implementación de un rendimiento de última generación para diversas tareas de predicción de propiedades.

Principales resultados:

• PeptiVerse demuestra un rendimiento de última generación en la predicción de diversas propiedades de péptidos.
• La plataforma integra tanto una interfaz web como una implementación de código abierto para su accesibilidad.
• Permite un análisis de desarrollabilidad de péptidos rápido, escalable y sistemático.

Conclusiones:

• PeptiVerse unifica la predicción de propiedades a través de diferentes representaciones de péptidos, abordando una brecha crítica en el desarrollo de péptidos terapéuticos.
• La plataforma facilita el análisis en etapas tempranas y el diseño generativo consciente de las propiedades, acelerando el desarrollo de nuevos péptidos terapéuticos.
• Su accesibilidad a través de opciones web y de código abierto promueve una adopción más amplia en el campo.