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Updated: Jan 13, 2026
09:51
Enhanced Genome Editing with Cas9 Ribonucleoprotein in Diverse Cells and Organisms
Published on: May 25, 2018
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PCdb: Una base de datos integral de edición genómica de plantas que integra la eficiencia de sgRNA, predicciones
Fan Wang1, Shengtao Lu1, Can Zhu1
1Joint International Research Laboratory of Metabolic and Developmental Sciences, School of Life Sciences and Biotechnology, Hainan research institute, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai 200240, P. R. China.
Plant communications
|January 9, 2026
Resumen
Una nueva Base de Datos de CRISPR para Plantas (PCdb) integra sgRNAs validados, contexto genómico y datos epigenómicos para la edición del genoma de plantas. Este recurso ayuda en el diseño de herramientas CRISPR/Cas eficientes y específicas para la mejora de cultivos.
Sus antecedentes:
- La edición genómica CRISPR/Cas es crucial para la biotecnología vegetal, y requiere un diseño eficaz de ARN guía único (sgRNA).
- Los recursos existentes para el diseño de sgRNA en plantas están fragmentados y carecen de integración con datos genómicos y epigenómicos.
- El contexto genómico y epigenómico afecta significativamente la eficacia y especificidad de la edición CRISPR/Cas en plantas.
Conclusiones:
- PCdb sirve como un recurso valioso e integrado para la investigación de la edición del genoma de plantas, facilitando el diseño y la evaluación del rendimiento de sgRNA.
- La incorporación del contexto epigenómico en PCdb proporciona información novedosa para mejorar la eficacia y especificidad de la edición CRISPR/Cas en plantas.
- La base de datos admite el análisis sistemático, ofreciendo un perfil de rendimiento completo para sgRNAs dentro de su contexto epigenómico nativo.
Palabras clave:
CRISPR-Cas9Accesibilidad de la cromatinaAnotación epigenómicaPredicción fuera de objetivoBase de conocimiento de edición del genoma de plantasActividad de sgRNA
