REFLEX: Perfilado Multiómico de Células T a Gran Escala con Secuenciación del Repertorio de Células T

Área de la Ciencia:

• Inmunología
• Genómica
• Bioinformática

Sus antecedentes:

• La comprensión de la heterogeneidad de las células T es crucial para analizar las respuestas inmunitarias.
• Las tecnologías actuales de una sola célula carecen del rendimiento para estudios complejos del repertorio inmunitario.

Objetivo del estudio:

• Presentar REFLEX, un método novedoso, escalable y rentable para células únicas.
• Permitir el perfilado multiómico de alto rendimiento con secuenciación emparejada del receptor de células T (TCR).

Principales métodos:

• REFLEX integra la transcripción inversa in situ y los códigos de multiplexación de muestras.
• Se combina perfectamente con la plataforma 10x FLEX para mejorar la captura de datos.
• El perfilado implicó más de 2 millones de células de expansiones de células T pulsadas con péptidos de CMV.

Principales resultados:

• Se capturaron con éxito secuencias de TCR y datos multiómicos de 1,4 millones de células T.
• Se identificaron numerosos y potenciales nuevos clonotipos reactivos a CMV.
• Se demostró una escala y profundidad sin precedentes en el análisis del repertorio de células T.

Conclusiones:

• REFLEX mejora significativamente la escala y la profundidad del perfilado inmunitario de una sola célula.
• El método ofrece información transformadora sobre la inmunidad adaptativa mediada por células T.
• REFLEX facilita el descubrimiento de respuestas de células T específicas de antígenos.