KNTC1 y PRC1 definen un microambiente inmunosupresor y un mal pronóstico en el liposarcoma

Área de la Ciencia:

• Oncología
• Inmunología
• Genética

Sus antecedentes:

• El liposarcoma (LPS) es un tumor de tejidos blandos heterogéneo donde los rasgos del microambiente inmunitario influyen en la progresión y el tratamiento.
• Los biomarcadores relacionados con el sistema inmunitario para la evaluación pronóstica en el LPS están poco explorados, a pesar de sus posibles implicaciones diagnósticas y terapéuticas.

Objetivo del estudio:

• Identificar biomarcadores robustos relacionados con el sistema inmunitario para la evaluación pronóstica en el liposarcoma.
• Desarrollar un modelo pronóstico que refleje la heterogeneidad del microambiente tumoral inmunitario y el potencial diagnóstico en el LPS.

Principales métodos:

• Se utilizaron datos de RNA-seq de las bases de datos GEO y TCGA para pacientes con liposarcoma.
• Se realizaron análisis de expresión génica diferencial, análisis de redes de coexpresión génica ponderada (WGCNA) y clustering de consenso basado en firmas inmunitarias.
• Se construyó un modelo de riesgo pronóstico utilizando regresión LASSO y Cox, validado con análisis ROC y ensayos funcionales.

Principales resultados:

• Se identificaron 852 genes con expresión diferencial y un módulo genético relacionado con el liposarcoma mediante WGCNA.
• Se estratificaron los pacientes en subtipos de inmunidad alta e inmunidad baja con resultados de supervivencia distintos.
• Se desarrolló una firma de dos genes (KNTC1 y PRC1) con alto rendimiento diagnóstico (AUC > 0.9) y asociación significativa con subtipos patológicos, metástasis y niveles de infiltración inmunitaria. La silenciamiento de KNTC1 alteró la migración e invasión celular.

Conclusiones:

• Se desarrolló un modelo pronóstico robusto de dos genes (KNTC1 y PRC1) para el liposarcoma.
• Este modelo predice eficazmente la supervivencia, refleja la heterogeneidad del microambiente inmunitario y distingue los subtipos patológicos.
• Los hallazgos ofrecen información para la estratificación pronóstica y las estrategias de tratamiento personalizadas en el LPS.