Proteómica de alto rendimiento habilitada por preacumulación paralelizada y procesamiento optimizado de iones en el...

Área de la Ciencia:

• Proteómica
• Espectrometría de masas
• Biología de sistemas

Sus antecedentes:

• La proteómica de alto rendimiento es esencial para la investigación biológica, pero está limitada por la tecnología actual de espectrometría de masas (MS).
• Los métodos de MS existentes enfrentan desafíos en velocidad, sensibilidad y escalabilidad para análisis de muestras grandes.

Objetivo del estudio:

• Presentar el Thermo Scientific Orbitrap Astral Zoom MS, diseñado para superar las limitaciones actuales en la proteómica de alto rendimiento.
• Mejorar la velocidad de adquisición, la utilización de iones y el procesamiento espectral para un análisis proteómico más profundo.

Principales métodos:

• Utilizó el Orbitrap Astral Zoom MS con velocidades de escaneo MS/MS ultrarrápidas de hasta 270 Hz.
• Implementó la preacumulación para mejorar la utilización de iones.
• Analizó lisado de células humanas para evaluar la profundidad proteómica y el rendimiento.

Principales resultados:

• Identificó aproximadamente 100 000 péptidos únicos y más de 8400 proteínas en un solo análisis de 300 muestras por día (SPD).
• Logró una cobertura proteómica casi completa (>12 000 proteínas) en 2,7 horas, una reducción del 40 % en el tiempo de análisis.
• Demostró capacidades de ultra alto rendimiento, identificando >7000 proteínas en un método de 500 SPD con alta reproducibilidad (correlaciones de Pearson por pares >0,99).

Conclusiones:

• El Orbitrap Astral Zoom MS ofrece avances significativos en velocidad, sensibilidad y escalabilidad para la proteómica.
• Esta tecnología permite la proteómica rutinaria a gran escala, apoyando aplicaciones en investigación clínica y biología de sistemas.
• El instrumento representa un gran paso adelante para el análisis proteómico de alto rendimiento.