Análisis computacional de CCN1 como diana farmacológica predice interacciones con compuestos bioactivos

Área de la Ciencia:

• Bioquímica y Biología Molecular
• Descubrimiento Computacional de Fármacos
• Genómica

Sus antecedentes:

• CCN1 es una proteína multifuncional implicada en el envejecimiento, la fibrosis, la inflamación y el cáncer.
• Sus complejos roles la convierten en una diana significativa para la intervención terapéutica.
• Evaluar la farmacabilidad de CCN1 es crucial para desarrollar terapias dirigidas.

Objetivo del estudio:

• Evaluar computacionalmente la farmacabilidad de la proteína CCN1.
• Identificar posibles moduladores de molécula pequeña de la actividad de CCN1.
• Establecer un flujo de trabajo escalable para el cribado dirigido a CCN1.

Principales métodos:

• Se predijo la estructura 3D de CCN1 utilizando AlphaFold 3.
• Se identificaron los sitios de unión utilizando Fpocket.
• Se evaluó la afinidad del ligando con el acoplamiento molecular de SwissDock.

Principales resultados:

• Se identificaron múltiples sitios de unión farmacables de alta confianza en CCN1.
• El sitio de unión principal se encuentra entre los dominios TSP-1 y CTCK.
• La Metformina mostró la mayor afinidad predicha (puntuación AC de SwissDock de -200.26).
• Las interacciones se mantuvieron estables en variantes de CCN1 y eliminaciones de sitios de unión, confirmando la robustez genética.

Conclusiones:

• CCN1 es una diana farmacable con potencial de modulación terapéutica.
• La Metformina y otros compuestos muestran promesa para dirigirse a CCN1 en el envejecimiento y la enfermedad.
• El flujo de trabajo in silico desarrollado permite el cribado rápido de terapias dirigidas a CCN1.