Jove
Visualize
Contáctanos
JoVE
x logofacebook logolinkedin logoyoutube logo
ACERCA DE JoVE
Visión GeneralLiderazgoBlogCentro de Ayuda JoVE
AUTORES
Proceso de PublicaciónConsejo EditorialAlcance y PolíticasRevisión por ParesPreguntas FrecuentesEnviar
BIBLIOTECARIOS
TestimoniosSuscripcionesAccesoRecursosConsejo Asesor de BibliotecasPreguntas Frecuentes
INVESTIGACIÓN
JoVE JournalMethods CollectionsJoVE Encyclopedia of ExperimentsArchivo
EDUCACIÓN
JoVE CoreJoVE BusinessJoVE Science EducationJoVE Lab ManualCentro de Recursos para ProfesoresSitio de Profesores
Términos y Condiciones de Uso
Política de Privacidad
Políticas

Videos de Conceptos Relacionados

Lethal Alleles02:41

Lethal Alleles

17.7K
Agouti: A Lethal Allele
Lucien Cuénot discovered lethal alleles in 1905 while studying the inheritance of coat color in mice. The agouti gene is responsible for the color of the coat in mice. This gene codes for an agouti-signaling protein, which is responsible for melanin distribution in mammals. The wild-type allele gives rise to gray-brown coat color in mice, while the mutant allele gives rise to yellow coat color. In addition to coat color, the agouti gene is associated with the yellow...
17.7K
Protein Networks02:26

Protein Networks

4.5K
An organism can have thousands of different proteins, and these proteins must cooperate to ensure the health of an organism. Proteins bind to other proteins and form complexes to carry out their functions. Many proteins interact with multiple other proteins creating a complex network of protein interactions.
These interactions can be represented through maps depicting protein-protein interaction networks, represented as nodes and edges. Nodes are circles that are representative of a protein,...
4.5K
Conserved Binding Sites01:49

Conserved Binding Sites

5.0K
Many proteins’ biological role depends on their interactions with their ligands, small molecules that bind to specific locations on the protein known as ligand-binding sites. Ligand-binding sites are often conserved among homologous proteins as these sites are critical for protein function.
Binding sites are often located in large pockets, and if their location on a protein’s surface is unknown, it can be predicted using various approaches. The energetic method computationally...
5.0K

También podría leer

Artículos Relacionados

Artículos vinculados a este trabajo por autores compartidos, revista y gráfico de citas.

Ordenar por
Same author

Gegen Qinlian Decoction Mitigates DSS-Induced Acute Colitis and Reinstates Gut Barrier Function in Mice, Correlating with Suppressed IL-33/ST2 Signaling.

Journal of inflammation research·2026
Same author

Prediction Models for Psychological Distress in Patients With Malignant Tumors: A Scoping Review.

Psycho-oncology·2026
Same author

Hypoxia-preconditioned dental pulp stem cells alleviate acetaminophen-induced liver failure via promoting MYC-HIF1A/HIF-1α-BNIP3-mediated mitophagy.

Autophagy·2026
Same author

The role of extracellular matrix stiffness in regulating fibroblast behaviors and disease progression.

Frontiers in immunology·2026
Same author

Optimizing the osteo-immunomodulatory balance: threshold-saturation effects of BMP-2-loaded allografts in the Masquelet's induced membrane technique (MIMT).

Frontiers in bioengineering and biotechnology·2026
Same author

A coupled heat-cold island network framework for urban heat island mitigation: a case study of Central Fuzhou.

Scientific reports·2026

Video Experimental Relacionado

Updated: Jan 18, 2026

A Data Integration Workflow to Identify Drug Combinations Targeting Synthetic Lethal Interactions
07:40

A Data Integration Workflow to Identify Drug Combinations Targeting Synthetic Lethal Interactions

Published on: May 27, 2021

4.5K

Struct2SL: Predicción de letalidad sintética basada en información de estructura de AlphaFold2 y Perceptrón Multicapa

Yurui Huang1, Ruzhe Yuan1, Yaxuan Li1

  • 1School of Computer Science and Technology, Harbin Institute of Technology (Shenzhen), Shenzhen, Guang Dong 518055, China.

Computational and structural biotechnology journal
|January 16, 2026
PubMed
Resumen

Struct2SL predice con precisión pares de genes de letalidad sintética (SL) integrando estructuras de proteínas y redes. Este enfoque computacional mejora la precisión y eficacia de la terapia contra el cáncer.

Palabras clave:
estructura de proteínas AlphaFold2perceptrón multicapapredicción de enlaces de redpredicción de letalidad sintética

Más Videos Relacionados

Identification and Classification of Position-specific GABAA Receptor Subunit Missense Variants for Their Role In Hippocampal Pyramidal Neurons
08:04

Identification and Classification of Position-specific GABAA Receptor Subunit Missense Variants for Their Role In Hippocampal Pyramidal Neurons

Published on: June 6, 2025

1.4K
Author Spotlight: A Computational Approach to Decipher Amino Acid Preferences in Multispecific Protein-Protein Interactions
06:50

Author Spotlight: A Computational Approach to Decipher Amino Acid Preferences in Multispecific Protein-Protein Interactions

Published on: January 26, 2024

2.5K

Videos de Experimentos Relacionados

Last Updated: Jan 18, 2026

A Data Integration Workflow to Identify Drug Combinations Targeting Synthetic Lethal Interactions
07:40

A Data Integration Workflow to Identify Drug Combinations Targeting Synthetic Lethal Interactions

Published on: May 27, 2021

4.5K
Identification and Classification of Position-specific GABAA Receptor Subunit Missense Variants for Their Role In Hippocampal Pyramidal Neurons
08:04

Identification and Classification of Position-specific GABAA Receptor Subunit Missense Variants for Their Role In Hippocampal Pyramidal Neurons

Published on: June 6, 2025

1.4K
Author Spotlight: A Computational Approach to Decipher Amino Acid Preferences in Multispecific Protein-Protein Interactions
06:50

Author Spotlight: A Computational Approach to Decipher Amino Acid Preferences in Multispecific Protein-Protein Interactions

Published on: January 26, 2024

2.5K

Área de la Ciencia:

  • Biología Computacional
  • Genómica
  • Bioinformática

Sus antecedentes:

  • Los principios de letalidad sintética (SL) ofrecen nuevas estrategias de tratamiento contra el cáncer.
  • La predicción computacional de pares de genes SL puede mejorar la precisión de la terapia contra el cáncer.
  • Los métodos existentes a menudo descuidan atributos proteicos cruciales como la estructura 3D y las redes de interacción.

Objetivo del estudio:

  • Introducir Struct2SL, un marco computacional novedoso para predecir pares de genes SL.
  • Integrar secuencias de proteínas, redes de interacción proteína-proteína (PPI) y estructuras 3D de proteínas para mejorar la precisión de la predicción.
  • Refinar la representación de características de las interacciones génicas para una identificación más precisa de los pares SL.

Principales métodos:

  • Se utilizó AlphaFold2 para predecir estructuras terciarias de proteínas, extrayendo atributos de secuencia y red.
  • Se desarrolló un proceso de incrustación de genes consolidando información de mapeo proteína-gen.
  • Se construyó un grafo de letalidad sintética para la incrustación de genes definitiva.
  • Se empleó un perceptrón multicapa para la predicción de interacciones SL.

Principales resultados:

  • Struct2SL demostró un rendimiento superior en comparación con cuatro métodos de vanguardia.
  • El marco logró una mayor precisión en la predicción de pares de genes SL.
  • La integración de características estructurales y de red demostró ser eficaz para la predicción de SL.

Conclusiones:

  • Struct2SL proporciona un enfoque computacional nuevo y eficiente para predecir pares de genes SL en la terapia contra el cáncer.
  • Los hallazgos sugieren que Struct2SL puede catalizar avances en el desarrollo de tratamientos oncológicos.
  • Se desarrolló un servidor web, Synthetic Lethality Query Server, para proporcionar a los investigadores una herramienta accesible para la predicción de pares de SL.