BodyMeta: Una base de datos completa de microbios en diversas condiciones patológicas y fisiológicas

Área de la Ciencia:

• Microbiología
• Bioinformática
• Genómica

Sus antecedentes:

• Las comunidades microbianas en diversos sitios del cuerpo son cruciales para la salud humana.
• Ocurren alteraciones significativas en estos microbiomas durante estados fisiológicos y patológicos.
• Se necesita una base de datos completa para estudiar estos cambios del microbioma en diversas condiciones y sitios del cuerpo.

Objetivo del estudio:

• Desarrollar BodyMeta, una base de datos metagenómica ampliada de comunidades microbianas de diversos sitios del cuerpo humano.
• Integrar datos de un número significativamente mayor de estudios en comparación con recursos anteriores.
• Proporcionar un recurso unificado para investigar los roles microbianos tanto en la salud como en la enfermedad.

Principales métodos:

• Se desarrolló BodyMeta actualizando y expandiendo la base de datos gutMEGA.
• Se integraron datos de 1261 estudios, incluidos conjuntos de datos de secuenciación basados en literatura y datos brutos (genoma completo y amplicones 16S).
• Se categorizaron 1842 condiciones (966 patológicas, 879 fisiológicas) en 31 sitios del cuerpo, anotando el contenido microbiano, la diversidad, los biomarcadores y las funciones.

Principales resultados:

• BodyMeta incorpora 1261 estudios, un aumento sustancial de 182.
• Catalogó 1842 condiciones en 31 sitios del cuerpo, con condiciones patológicas clasificadas usando términos MeSH.
• Anotó taxones microbianos (59010 de la literatura, 40657 de datos brutos) y compiló información experimental y de literatura exhaustiva.

Conclusiones:

• BodyMeta sirve como un recurso completo y de acceso público para la investigación metagenómica.
• Facilita el estudio de las alteraciones de las comunidades microbianas en diversas condiciones fisiológicas y patológicas.
• Apoya los avances en la comprensión de la relación entre el microbioma y la salud humana.