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Updated: Jan 18, 2026

Incorporating Target Protein Structure Flexibility and Dynamics in Computational Drug Discovery Using Ensemble-Based Docking Analysis
Published on: June 20, 2025
Prompt-to-Pill: Tubería de Descubrimiento de Fármacos y Simulación Clínica Multiagente
Ivana Vichentijevikj1, Kostadin Mishev2, Monika Simjanoska Misheva2
1iReason LLC, Skopje 1000, North Macedonia.
Este estudio presenta Prompt-to-Pill, un marco de IA para el descubrimiento de fármacos y la simulación de ensayos clínicos. Utiliza modelos de lenguaje grandes (LLM) para optimizar todo el pipeline de desarrollo de fármacos de forma virtual.
Área de la Ciencia:
- Química computacional y farmacología
- Inteligencia artificial en medicina
- Descubrimiento y desarrollo de fármacos
Sus antecedentes:
- El descubrimiento tradicional de fármacos es largo y costoso.
- Los modelos de lenguaje grandes (LLM) muestran potencial en diversas aplicaciones científicas.
- La integración de LLM en todo el pipeline de desarrollo de fármacos sigue siendo un desafío.
Objetivo del estudio:
- Presentar un marco de IA integral y modular para el descubrimiento de fármacos y la simulación de ensayos clínicos.
- Demostrar la viabilidad de un sistema multiagente basado en LLM para el desarrollo virtual de fármacos.
- Cerrar la brecha entre la investigación preclínica y el desarrollo clínico utilizando IA.
Principales métodos:
- Desarrolló una arquitectura Prompt-to-Pill utilizando un sistema multiagente (MAS) con LLM especializados.
- Implementó un flujo de trabajo que cubre la identificación de objetivos, la generación molecular, la predicción de ADMET, el acoplamiento y la optimización de líderes.
- Simuló fases de ensayos clínicos, incluida la contratación de pacientes y la predicción de resultados utilizando datos de EHR.
Principales resultados:
- Demostró con éxito el marco de IA de extremo a extremo utilizando Dipeptidil Peptidasa 4 (DPP4) como caso de uso.
- Integró LLM generativos, predictivos y basados en recuperación para la operación fluida del flujo de trabajo.
- Mostró el potencial de los agentes basados en LLM para operacionalizar el desarrollo de fármacos *in silico*.
Conclusiones:
- El marco Prompt-to-Pill ofrece un enfoque novedoso para el descubrimiento de fármacos impulsado por IA y los ensayos clínicos virtuales.
- Los sistemas multiagente basados en LLM pueden acelerar y optimizar significativamente el proceso de desarrollo de fármacos.
- Este trabajo proporciona una base para futuras aplicaciones de IA en la investigación farmacéutica.
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