Jove
Visualize
Contáctanos
JoVE
x logofacebook logolinkedin logoyoutube logo
ACERCA DE JoVE
Visión GeneralLiderazgoBlogCentro de Ayuda JoVE
AUTORES
Proceso de PublicaciónConsejo EditorialAlcance y PolíticasRevisión por ParesPreguntas FrecuentesEnviar
BIBLIOTECARIOS
TestimoniosSuscripcionesAccesoRecursosConsejo Asesor de BibliotecasPreguntas Frecuentes
INVESTIGACIÓN
JoVE JournalMethods CollectionsJoVE Encyclopedia of ExperimentsArchivo
EDUCACIÓN
JoVE CoreJoVE BusinessJoVE Science EducationJoVE Lab ManualCentro de Recursos para ProfesoresSitio de Profesores
Términos y Condiciones de Uso
Política de Privacidad
Políticas

Videos de Conceptos Relacionados

Leaky Scanning02:28

Leaky Scanning

5.6K
During most eukaryotic translation processes, the small 40S ribosome subunit scans an mRNA from its 5' end until it encounters the first start AUG codon. The large 60S ribosomal subunit then joins the smaller one to initiate protein synthesis. The location of the translation initiation is largely determined by the nucleotides near the start codon as there may be multiple translation initiation sites present on the mRNA.  Marilyn Kozak discovered that the sequence RCCAUGG (where R...
5.6K
Size and Structure of Viral Genomes01:26

Size and Structure of Viral Genomes

703
Viral genomes exhibit remarkable diversity in size, structure, and composition, influencing their replication strategies and interactions with host cells. These genomes consist of either DNA or RNA and may be linear or circular. Additionally, they can be single-stranded or double-stranded, with each configuration affecting how the virus propagates within a host. RNA viruses, for instance, generally have smaller genomes than DNA viruses, a factor that contributes to their high mutation rates and...
703

También podría leer

Artículos Relacionados

Artículos vinculados a este trabajo por autores compartidos, revista y gráfico de citas.

Ordenar por
Same author

Towards a phylogenetically informed approach to solving protein-protein interactions.

Biochemical Society transactions·2025
Same author

Phase separation of mycobacterial Rho factor is associated with acid stress.

bioRxiv : the preprint server for biology·2025
Same author

RIBOSS detects novel translational events by combining long- and short-read transcriptome and translatome profiling.

Briefings in bioinformatics·2025
Same author

Multi-stressor dynamics: Effects of marine heatwave stress and harmful algal blooms on juvenile mussel (Perna canaliculus) survival and physiology.

The Science of the total environment·2025
Same author

Phage anti-CRISPR control by an RNA- and DNA-binding helix-turn-helix protein.

Nature·2024
Same author

Diversification of the Rho transcription termination factor in bacteria.

Nucleic acids research·2024

Video Experimental Relacionado

Updated: Jan 18, 2026

Detection of Low Copy Number Integrated Viral DNA Formed by In Vitro Hepatitis B Infection
11:14

Detection of Low Copy Number Integrated Viral DNA Formed by In Vitro Hepatitis B Infection

Published on: November 7, 2018

18.8K

Descifrando los patrones de empalme interconectados del virus de la hepatitis B y el huésped utilizando modelos de

Chun Shen Lim1,2,3, Chris M Brown1,2,3

  • 1Department of Biochemistry, Faculty of Biomedical Sciences, University of Otago, Dunedin, New Zealand.

Microbial genomics
|January 16, 2026
PubMed
Resumen

La eficiencia del empalme del virus de la hepatitis B (VHB), no solo la cantidad de ARN empalmado, se correlaciona fuertemente con la progresión de la enfermedad. Los modelos de inteligencia artificial revelan patrones únicos de empalme del VHB, lo que ayuda a comprender la persistencia viral.

Palabras clave:
inteligencia artificialsecuenciación profundamodelo de lenguaje grandeeficiencia de empalmecoevolución virus-huésped

Más Videos Relacionados

Modeling Hepatitis B Virus Infection in Non-Hepatic 293T-NE-3NRs Cells
09:02

Modeling Hepatitis B Virus Infection in Non-Hepatic 293T-NE-3NRs Cells

Published on: June 5, 2020

7.9K
DNA Virus Detection System Based on RPA-CRISPR/Cas12a-SPM and Deep Learning
04:17

DNA Virus Detection System Based on RPA-CRISPR/Cas12a-SPM and Deep Learning

Published on: May 10, 2024

1.5K

Videos de Experimentos Relacionados

Last Updated: Jan 18, 2026

Detection of Low Copy Number Integrated Viral DNA Formed by In Vitro Hepatitis B Infection
11:14

Detection of Low Copy Number Integrated Viral DNA Formed by In Vitro Hepatitis B Infection

Published on: November 7, 2018

18.8K
Modeling Hepatitis B Virus Infection in Non-Hepatic 293T-NE-3NRs Cells
09:02

Modeling Hepatitis B Virus Infection in Non-Hepatic 293T-NE-3NRs Cells

Published on: June 5, 2020

7.9K
DNA Virus Detection System Based on RPA-CRISPR/Cas12a-SPM and Deep Learning
04:17

DNA Virus Detection System Based on RPA-CRISPR/Cas12a-SPM and Deep Learning

Published on: May 10, 2024

1.5K

Área de la Ciencia:

  • Virología
  • Genómica
  • Bioinformática

Sus antecedentes:

  • La infección por el virus de la hepatitis B (VHB) es una de las principales causas de cáncer de hígado y muerte.
  • El genoma compacto del VHB utiliza un empalme alternativo extenso, lo que contribuye a la evasión inmunitaria y dificulta las curas funcionales.
  • Comprender el empalme del VHB es crucial para desarrollar tratamientos eficaces.

Objetivo del estudio:

  • Investigar la correlación entre la eficiencia del empalme del VHB y la progresión de la enfermedad.
  • Decodificar los determinantes de la secuencia del empalme del VHB utilizando modelos de IA.
  • Analizar patrones de empalme específicos del contexto y del genotipo en el VHB.

Principales métodos:

  • Se cuantificó la eficiencia del empalme del VHB a partir de 279 bibliotecas de secuenciación de ARN.
  • Se aplicaron modelos de IA (SpliceBERT, OpenSpliceAI) a 4.706 genomas de VHB.
  • Se realizaron análisis de conservación de motivos y propensión al empalme.

Principales resultados:

  • La eficiencia del empalme del VHB se correlaciona más fuertemente con la progresión de la enfermedad que la proporción de ARN del VHB empalmado.
  • Los sitios donantes de empalme del VHB se parecen a los sitios del huésped, mientras que los sitios aceptores son más crípticos.
  • Se identificaron patrones de empalme específicos del contexto y del genotipo, lo que sugiere una regulación basada en secuencias.

Conclusiones:

  • La eficiencia del empalme del VHB es un indicador más significativo de la progresión de la enfermedad de lo que se pensaba anteriormente.
  • Los modelos de IA decodifican eficazmente los patrones de empalme viral, revelando características únicas de los sitios de empalme del VHB.
  • Los patrones de empalme del VHB pueden reflejar la coevolución con los huéspedes, lo que apoya la persistencia viral y la evasión inmunitaria.