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Updated: Jan 20, 2026

SELEX-Based In Vitro Binding Assay to Identify RNA-Protein Interactions
Exploración de las interacciones fasina-polihidroxialcanoato mediante ensayos de unión in vivo e in vitro
Maria-Tsampika Manoli1, Paula Llamas1, Francisco G Blanco1
1Polymer Biotechnology Group, Department of Biotechnology, Margarita Salas Center for Biological Research (CIB-CSIC), Madrid, Spain.
Dos proteínas bacterianas, PhaP1 y PhaI, influyen en la formación de gránulos de polihidroxialcanoato (PHA) y en las propiedades de su superficie. Sus distintas afinidades de unión a diferentes tipos de PHA ofrecen potencial para aplicaciones específicas basadas en biotecnología.
Área de la Ciencia:
- Biotecnología y Biología Sintética
- Ciencia e Ingeniería de Polímeros
- Fisiología Microbiana
Sus antecedentes:
- Los polihidroxialcanoatos (PHA) son poliésteres biodegradables producidos por bacterias.
- Las proteínas asociadas a gránulos (GAPs), en particular las fasinas, son cruciales para la formación y el metabolismo de los gránulos de PHA.
- Las fasinas se están explorando para la funcionalización de superficies de PHA en diversas aplicaciones biotecnológicas.
Objetivo del estudio:
- Investigar la afinidad de unión y la influencia de dos fasinas específicas, PhaP1 y PhaI, en la acumulación de PHA y la morfología de los gránulos.
- Evaluar estos efectos en cepas de ingeniería de Pseudomonas putida KT2440 que producen distintas composiciones de PHA (PHA de cadena corta [scl-PHA], PHA de cadena media [mcl-PHA] y PHA híbrido scl/mcl-PHA).
- Explorar el potencial de las fasinas como etiquetas de bioafinidad para la funcionalización selectiva de PHA.
Principales métodos:
- Expresión de proteínas de fusión fasina-msfGFP en cepas de Pseudomonas putida de ingeniería.
- Ensayos de unión de fluorescencia in vivo para monitorizar la unión de fasinas a la superficie.
- Microscopía y Cromatografía de Gases-Espectrometría de Masas (GC-MS) para el análisis de la acumulación de PHA.
- Microscopía Electrónica de Transmisión (TEM) para la evaluación de la morfología de los gránulos.
- Citometría de flujo para el análisis de afinidad diferencial de la superficie.
Principales resultados:
- La expresión de fasinas no alteró significativamente el rendimiento general de PHA (%PHA/CDW) pero influyó en las características de los gránulos.
- La expresión de PhaI en la cepa productora de mcl-PHA PP00_01 aumentó el número y la homogeneidad de los gránulos.
- La citometría de flujo reveló afinidades diferenciales de unión de fasinas a la superficie según el tipo de PHA, con preferencia de PhaP1 por scl-PHA y de PhaI por mcl-PHA.
- Las propiedades fisicoquímicas del PHA y el tipo de fasina influyen colectivamente en la fuerza de unión.
Conclusiones:
- Las fasinas desempeñan un doble papel en la modulación de la producción de PHA y en la habilitación de la funcionalización selectiva de los gránulos de PHA.
- Las preferencias de unión distintas de PhaP1 y PhaI para diferentes tipos de PHA resaltan su potencial como etiquetas de bioafinidad específicas.
- Este estudio apoya el uso de fasinas para la modificación superficial dirigida de gránulos de PHA en aplicaciones biotecnológicas como la inmovilización de enzimas y la administración de fármacos.
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