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Updated: Jan 23, 2026

A Workflow for the Quantitative Assessment of the Endophytic and Epiphytic Bacterial Microbiomes of the Bark of Populus trichocarpa
Published on: June 27, 2025
Dinámica de la Comunidad Bacteriana Endófita Tolerante a la Sequía en Zonas Agroclimáticas Contrastantes
Lopamudra Hazra1, Sudipto Biswas1, Kunal Kumar Saha2
1Environmental Microbiology and Stress Physiology Laboratory, Department of Botany, Visva Bharati, Santiniketan, West Bengal, India.
El arroz de tierras altas indígena alberga bacterias endófitas resilientes que mejoran la tolerancia a la sequía. Estos microbios ofrecen una estrategia sostenible para mejorar el cultivo de arroz en entornos con limitaciones de agua.
Área de la Ciencia:
- Microbiología
- Ciencia de las plantas
- Ciencia agrícola
Sus antecedentes:
- El arroz (Oryza sativa) es un alimento básico mundial vulnerable a la sequía, especialmente en sistemas de secano.
- Los microbiomas endófitos ofrecen un enfoque sostenible para mejorar la resiliencia al estrés de las plantas.
- El potencial funcional de los endófitos en los landraces de arroz tradicionales está en gran parte sin caracterizar.
Objetivo del estudio:
- Investigar las comunidades bacterianas endófitas en cultivares indígenas de arroz de tierras altas y bajas de Bengala Occidental, India.
- Explorar el potencial funcional de estos endófitos para la resiliencia a la sequía.
- Identificar cepas bacterianas específicas y sus mecanismos para mejorar el rendimiento del arroz con limitaciones de agua.
Principales métodos:
- Secuenciación de amplicones de ARNr 16S para la caracterización de la comunidad bacteriana.
- Perfilado funcional predictivo (PICRUSt2) de genomas microbianos.
- Cribado basado en cultivo de aislados endófitos para la tolerancia al estrés.
- Validación bioquímica de la producción de osmolitos y ensayos con plantas.
Principales resultados:
- Diferentes ensamblajes de bacterias endófitas se asociaron con los agroecosistemas de arroz de tierras altas y bajas.
- Los endófitos del arroz de tierras altas se enriquecieron en taxones adaptados al estrés (Proteobacteria, Actinobacteria, Firmicutes).
- Se predijeron vías funcionales clave para la biosíntesis de osmolitos y la defensa antioxidante en los microbiomas de tierras altas.
- Las bacterias aisladas (Enterobacter sp. KNR1, Klebsiella sp. GBR1) mostraron una alta tolerancia al estrés osmótico y produjeron compuestos beneficiosos (prolina, glicina betaína, IAA, EPS).
Conclusiones:
- Los landraces indígenas de arroz de tierras altas son una fuente valiosa de bacterias endófitas funcionalmente resilientes.
- Estos endófitos poseen mecanismos para la adaptación al estrés por sequía, incluida la producción de osmolitos y la colonización de raíces.
- Los endófitos identificados proporcionan una base para el desarrollo de consorcios microbianos para mejorar la resiliencia a la sequía del arroz.
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