Diversidad genética y dinámicas evolutivas del Senecavirus A en Brasil

Área de la Ciencia:

• Virología Veterinaria
• Epidemiología Molecular
• Investigación de Picornavirus

Sus antecedentes:

• El Senecavirus A (SVA), un picornavirus, se ha relacionado con brotes de enfermedad vesicular en hatos de cerdos brasileños desde 2014.
• Existe información limitada sobre la diversidad genética y las dinámicas evolutivas del SVA dentro de Brasil.

Objetivo del estudio:

• Investigar la diversidad genética, la evolución y la epidemiología del Senecavirus A en Brasil.
• Analizar genomas de SVA de cerdos brasileños para comprender su relación con cepas globales.

Principales métodos:

• Aislamiento de SVA de cerdos con lesiones vesiculares en 57 municipios de 8 estados brasileños (2018-2022).
• Secuenciación del genoma completo de 501 aislados de SVA utilizando tecnologías Sanger y Oxford Nanopore.
• Se realizaron análisis filogenéticos, de comparación de secuencias por pares y de recombinación.

Principales resultados:

• Las secuencias brasileñas de SVA forman un clúster monofilético distinto, separado de las cepas internacionales, lo que indica un ancestro común brasileño.
• Se identificaron dos clústeres genéticos principales dentro de Brasil (regiones del Medio Oeste y Sur), lo que sugiere una evolución independiente.
• Se encontraron siete mutaciones únicas de alta frecuencia en el SVA brasileño, incluidas aquellas en proteínas de la cápside que interactúan con ANTRX1 y residuos expuestos en la superficie.
• Se detectó evidencia de al menos cinco eventos de recombinación entre cepas de SVA brasileñas.

Conclusiones:

• Las cepas brasileñas de SVA exhiben trayectorias evolutivas únicas, distintas de sus contrapartes globales.
• Los hallazgos sugieren una evolución independiente continua del SVA dentro de Brasil, potencialmente influenciada por las interacciones con los receptores del huésped y la presión inmunológica.
• Este estudio proporciona información crucial sobre la epidemiología molecular y las dinámicas evolutivas del SVA en Brasil y a nivel mundial.