Un genoma de Treponema pallidum de hace 5500 años de Sabana de Bogotá, Colombia

Área de la Ciencia:

• La paleogenómica
• Microbiología evolutiva
• Análisis de ADN antiguo

Sus antecedentes:

• La treponematosis, causada por las subespecies de Treponema pallidum (sífilis, yaws, bejel, pinta), tiene una larga historia en los humanos.
• La historia evolutiva y la diversidad antigua de los patógenos de Treponema siguen siendo poco conocidas.
• Los estudios anteriores carecían de datos genómicos antiguos para rastrear el profundo pasado evolutivo de estas bacterias.

Objetivo del estudio:

• Para reconstruir la historia evolutiva de las subespecies de Treponema pallidum.
• Para investigar la antigua presencia y diversificación de patógenos treponemales en las Américas.
• Para extender el registro genómico de los patógenos treponemales utilizando ADN antiguo.

Principales métodos:

• Extracción de ADN antiguo (ADN) y secuenciación de todo el genoma de un genoma de Treponema de 5500 años de antigüedad (TE1-3).
• Análisis filogenético para determinar la posición evolutiva del genoma antiguo en relación con las subespecies modernas de Treponema pallidum.
• Análisis bioinformático de datos genómicos para inferir la historia de la población y los tiempos de divergencia.

Principales resultados:

• Un genoma de Treponema de 5500 años de antigüedad (TE1-3) fue recuperado de restos de cazadores-recolectores del Holoceno Medio en Colombia.
• Los análisis filogenéticos posicionaron a TE1-3 como un linaje hermano de todas las subespecies conocidas de Treponema pallidum.
• Este antiguo linaje es anterior a la diversificación de las subespecies modernas y al contacto europeo, lo que indica una historia profunda en las Américas.

Conclusiones:

• El descubrimiento del genoma TE1-3 expande significativamente la diversidad conocida de Treponema pallidum.
• Este hallazgo proporciona evidencia molecular de la antigua presencia de patógenos treponemales en las Américas, anteriores a la colonización europea por milenios.
• El estudio establece una nueva línea de tiempo molecular para la evolución y distribución geográfica de los patógenos de Treponema.