Toxicología de redes integrada, aprendizaje automático y análisis bioinformático revelan disfunción de la coagulación...

Área de la Ciencia:

• Toxicología ambiental
• Hematología
• Biología computacional

Sus antecedentes:

• La disfunción de la coagulación es un trastorno hematológico común con influencias ambientales poco comprendidas.
• El dehidroacetato de sodio (SDA) es un contaminante emergente relacionado con la alteración inmunológica y las anomalías de la coagulación.
• Se deben dilucidar los mecanismos precisos de la disfunción de la coagulación inducida por SDA.

Objetivo del estudio:

• Investigar sistemáticamente los mecanismos de la disfunción de la coagulación inducida por dehidroacetato de sodio (SDA) utilizando un enfoque computacional integrado.
• Identificar los objetivos moleculares y las vías clave afectadas por la exposición a SDA.
• Explorar el potencial diagnóstico de los objetivos identificados en los trastornos de la coagulación.

Principales métodos:

• Se emplearon toxicología de redes, aprendizaje automático (LASSO, XGBoost), bioinformática, acoplamiento molecular y simulaciones de dinámica molecular.
• Identificación y análisis de posibles objetivos de SDA y vías enriquecidas.
• Validación utilizando un conjunto de datos de cáncer colorrectal (GSE52060) y análisis diagnóstico (ROC).

Principales resultados:

• Se identificaron 191 posibles objetivos de SDA, enriquecidos en vías de cáncer y aterosclerosis.
• El protooncogén Met (Met) se identificó como un objetivo central a través del aprendizaje automático.
• Se observó una expresión elevada de Met en pacientes con disfunción de la coagulación y un fuerte valor diagnóstico (AUC=0,856), con una unión estable SDA-Met confirmada.

Conclusiones:

• Este estudio proporciona un marco computacional para comprender el papel de SDA en la disfunción de la coagulación.
• El protooncogén Met (Met) es un objetivo molecular clave implicado en las anomalías de la coagulación inducidas por SDA.
• Los hallazgos respaldan el desarrollo de futuras estrategias preventivas y terapéuticas para los trastornos hematológicos inducidos por contaminantes ambientales.