Evolución estratégica de aptámeros para SARS-CoV-2 para permitir la detección en saliva humana

Área de la Ciencia:

• Biotecnología
• Biología Molecular
• Tecnología de Biosensores

Sus antecedentes:

• Los aptámeros son cruciales para los biosensores, pero enfrentan desafíos de afinidad y especificidad en muestras complejas como la saliva.
• La SELEX convencional (Evolución Sistemática de Ligandos mediante Enriquecimiento Exponencial) puede no optimizar completamente el rendimiento del aptámero para aplicaciones del mundo real.

Objetivo del estudio:

• Mejorar la afinidad y especificidad del aptámero para la detección de SARS-CoV-2 en saliva humana.
• Introducir la mutación de inosina como una estrategia de optimización post-SELEX.

Principales métodos:

• La mutación de inosina se incorporó en un proceso de maduración in silico (ISM) después de SELEX.
• Se identificó un aptámero optimizado, WiS-914, después de ISM integrado con inosina.
• Se evaluó el rendimiento del aptámero para detectar SARS-CoV-2 inactivado en saliva humana.

Principales resultados:

• La incorporación de inosina amplió la diversidad de secuencias y alteró las interacciones aptámero-proteína.
• El aptámero optimizado WiS-914 demostró una afinidad y especificidad mejoradas para SARS-CoV-2.
• WiS-914 permitió una detección más sensible de SARS-CoV-2 en saliva humana con un límite de detección más bajo.

Conclusiones:

• La ISM integrada con inosina es una técnica de optimización post-SELEX eficaz para aptámeros.
• Este método genera aptámeros de alto rendimiento adecuados para detectar objetivos en muestras biológicas como la saliva.
• El aptámero optimizado WiS-914 muestra potencial para plataformas de detección de SARS-CoV-2 convenientes y in situ.