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Updated: Jan 27, 2026

Semi-Quantitative Analysis of Peptidoglycan by Liquid Chromatography Mass Spectrometry and Bioinformatics
Published on: October 13, 2020
Evaluación comparativa del flujo de trabajo de perfilado de características y componentes para el análisis de
Samuele Pellacani1, Giorgio Tomasi2, Gerrit Renner3
1Department of Chemical and Geological Science, University of Modena and Reggio Emia, Via Campi 103, Modena, Italy; Department of Plant and Environmental Science, University of Copenhagen, Thorvaldsensvej 40, 1871 Frederiksberg C, Denmark.
Se compararon los flujos de trabajo de cribado no dirigido (NTS) de cromatografía de fluidos supercríticos-espectrometría de masas de alta resolución (SFCHRMS). El enfoque de perfil de componentes (CP) (ROI-CODA-MCR) mostró una fiabilidad de intensidad y un filtrado de blancos superiores al flujo de trabajo de perfil de características (FP) (MS-DIAL).
Área de la Ciencia:
- Química Analítica
- Ciencias Ambientales
- Espectrometría de Masas
Sus antecedentes:
- La cromatografía de fluidos supercríticos acoplada a espectrometría de masas de alta resolución (SFCHRMS) se utiliza cada vez más para el cribado no dirigido (NTS).
- Las evaluaciones sistemáticas de los flujos de trabajo de procesamiento de datos de SFCHRMS son limitadas.
- Comprender el rendimiento del flujo de trabajo es crucial para el análisis preciso de muestras ambientales.
Objetivo del estudio:
- Comparar exhaustivamente un flujo de trabajo de perfil de componentes (CP) (ROI-CODA-MCR) frente a un flujo de trabajo de perfil de características (FP) (MS-DIAL) para NTS de SFCHRMS.
- Evaluar su rendimiento en la detección de estándares, la fiabilidad de la intensidad, el filtrado de blancos y la detección de sospechosos.
- Identificar desafíos y optimizar parámetros para el procesamiento de datos de SFCHRMS.
Principales métodos:
- Comparación del análisis de Región de Interés combinado con el Algoritmo de Detección de Componentes y la Resolución de Curvas Multivariantes (ROI-CODA-MCR) y MS-DIAL.
- Se utilizaron cromatogramas iónicos extraídos (EIC) como verdad fundamental para la optimización y la evaluación comparativa.
- Se evaluó el rendimiento utilizando estándares, muestras en blanco y muestras de aguas residuales para NTS.
Principales resultados:
- Ambos flujos de trabajo detectaron un número similar de estándares (33-35/37).
- Las intensidades de ROI-CODA-MCR coincidieron estrechamente con las EIC (ratio ≈1, RSD = 5.8%), mientras que las intensidades de MS-DIAL se desviaron significativamente (hasta 100 veces, RSD >200%).
- ROI-CODA-MCR arrojó menos componentes (≈200) con un mejor filtrado de blancos y resolución, mientras que MS-DIAL produjo más características (≈1000) con tasas de falsos positivos más altas.
Conclusiones:
- El enfoque CP (ROI-CODA-MCR) ofrece una fiabilidad de intensidad y una calidad de datos superiores para NTS de SFCHRMS en comparación con el enfoque FP (MS-DIAL).
- MS-DIAL detectó más compuestos sospechosos pero mostró un mayor riesgo de falsos negativos para señales de baja intensidad.
- Las intensas señales de fondo en los conjuntos de datos de SFCHRMS desafían a ambos flujos de trabajo, lo que requiere una cuidadosa optimización de los parámetros.
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