Perfilado transcriptómico y de célula única revelan evasión inmune impulsada por la estirpe en el cáncer de pulmón...

Área de la Ciencia:

• Oncología
• Inmunología
• Medicina del Sueño

Sus antecedentes:

• La apnea obstructiva del sueño (AOS) implica hipoxia intermitente (HI) recurrente, cada vez más relacionada con la incidencia y mortalidad del cáncer de pulmón.
• La relación entre la HI, la remodelación inmune, la estirpe y la resistencia terapéutica en el cáncer de pulmón requiere una mayor elucidación.

Objetivo del estudio:

• Investigar el impacto de la HI en las poblaciones de células inmunitarias y los patrones transcripcionales en el cáncer de pulmón.
• Evaluar la asociación entre la estirpe tumoral y la expresión de puntos de control inmunitario, la resistencia terapéutica y el pronóstico del paciente.
• Desarrollar y validar una firma de genes basada en la estirpe para el pronóstico del cáncer de pulmón.

Principales métodos:

• Se integró la secuenciación de ARN de célula única de tejido pulmonar murino expuesto a HI con datos transcriptómicos a granel de las cohortes TCGA-LUAD y GSE31210.
• Se cuantificó la estirpe utilizando CytoTRACE y puntuación basada en el transcriptoma.
• Se evaluaron las asociaciones con la infiltración inmune, los puntos de control inmunitario, las puntuaciones TIDE, la sensibilidad a los fármacos y la respuesta a la inmunoterapia.
• Se construyó y validó un modelo pronóstico utilizando la regresión de Cox LASSO.

Principales resultados:

• La HI indujo una remodelación inmune significativa, incluyendo la expansión de células T efectoras y monocitos/macrófagos, con reducción de células B y células dendríticas.
• Los tumores de alta estirpe mostraron firmas de estrés mitocondrial/metabólico, aumento de la expresión de genes de puntos de control inmunitario (PD-1, PD-L1, CTLA4, LAG3) y puntuaciones TIDE más altas.
• La estirpe elevada se correlacionó con un peor pronóstico y una menor respuesta a la inmunoterapia.
• Una firma de seis genes de estirpe (EIF5A, MELTF, SEMA3C, CPS1, TCN1, SELENOK) estratificó de manera robusta a los pacientes en grupos de alto y bajo riesgo.

Conclusiones:

• La HI asociada a la AOS promueve la estirpe, la inmunosupresión y los resultados adversos en el cáncer de pulmón.
• La firma de estirpe identificada sirve como biomarcador pronóstico.
• El tratamiento de la estirpe y los puntos de control inmunitario puede mejorar la eficacia de la inmunoterapia en el cáncer de pulmón asociado a la AOS.