Caracterización de la tuberculosis pulmonar en la región de gran altitud mediante secuenciación dirigida de nanoporos

Área de la Ciencia:

• Medicina de gran altitud
• Epidemiología de enfermedades infecciosas
• Aplicaciones de secuenciación genómica

Sus antecedentes:

• Xizang (Tíbet) se enfrenta a una alta incidencia de tuberculosis (TB), agravada por altitudes extremas (≥3000 m) y hipoxia, lo que dificulta el diagnóstico.
• Comprensión limitada de las características clínicas y biológicas de la TB en entornos de gran altitud.

Objetivo del estudio:

• Investigar las características de la tuberculosis pulmonar en Xizang de gran altitud utilizando secuenciación avanzada.
• Comparar los datos de pacientes con TB de Xizang de gran altitud con una cohorte de baja altitud para evaluar el impacto de la altitud en la biología de Mycobacterium tuberculosis.

Principales métodos:

• TB-seq, un método de secuenciación dirigida por nanoporos, analizó esputo de 158 pacientes con TB pulmonar en Xizang.
• Se evaluó la carga bacteriana, el panorama de los genes de resistencia a los medicamentos y los fenotipos clínicos.
• Se incluyó un grupo de baja altitud emparejado (<1000 m) para el análisis comparativo.

Principales resultados:

• Los casos de retratamiento representaron el 58,23% de los pacientes con TB en Xizang; el tipo I de TB fue el más común (79,75%).
• La carga bacteriana disminuyó con la edad y fue mayor en los casos de retratamiento, lo que se correlacionó con marcadores inflamatorios.
• Se encontraron mutaciones genéticas farmacorresistentes en el 22,78% de los pacientes, siendo rpsL, rpoB y katG los genes clave. Los pacientes de gran altitud tuvieron una menor carga bacteriana y una menor resistencia a los medicamentos en comparación con los controles de baja altitud.

Conclusiones:

• La tuberculosis en Xizang se caracteriza por frecuentes casos de retratamiento, baja carga bacteriana y disminución de las mutaciones de resistencia a los medicamentos.
• La altitud puede suprimir la cantidad de bacterias e influir en la selección de mecanismos de resistencia específicos.
• Los hallazgos resaltan la necesidad de un control específico de la TB en Xizang, teniendo en cuenta las interacciones ambientales, del patógeno y del huésped.